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原创 dynamo使用教程
相似的粒子与相似的参考有更高的相关性,最终会聚集在一起。每个粒子在表中都有一个条目,包含移动和旋转来描述它的方向(默认情况下,这些值初始化为零)。当您打开一个新的断层图时,请确保在被要求时从内存中删除模型池。这对存储在磁盘中的模型没有影响,并且为了确保您没有混合来自不同层析图的模型,这是必要的。对于现实生活中的断层图,请记住,在将文件加载到内存之前,您需要预先保存这些文件。在新窗口中,将数据名称更改为有意义的名称,例如thermosomeParticles,将边长从32更改为48,然后单击。
2023-10-17 20:08:01
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原创 【论文阅读】Cyro-EM数据处理软件Dynamo
首先,Dynamo允许用户透明地适应各种高性能计算平台,如gpu或CPU集群。其次,Dynamo通过GUI界面和脚本资源实现了用户友好性。第三,Dynamo通过插件API提供用户灵活性。除了校准和平均程序,Dynamo还包括用于可视化和分析结果和数据的本地工具,以及对第三方可视化软件的支持,如Chimera UCSF或EMAN2。作为这些功能的一个演示,我们研究了细菌鞭毛马达,并显示自动检测的类缺乏和存在的c环。
2023-10-13 11:00:28
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原创 【实操记录】Conda常用操作
清华源使用指南网站:anaconda | 镜像站使用帮助 | 清华大学开源软件镜像站 | Tsinghua Open Source Mirror低版本python安装opencv-python较慢,最后报错遇到问题的命令:解决方法:更改opencv版本 (py3.6对应的最高版本)(进入指定虚拟环境后也可用pip命令)jupyter notebook 添加虚拟环境先进入虚拟环境 (myenv更换为自己的虚拟环境名称)进入虚拟环境后,下载ipykernel最后重新进入jupyter选择虚
2023-10-11 10:24:23
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原创 【论文阅读】DeepContact:基于电子显微镜成像的MCS高通量量化
膜接触点(MCS)介导的细胞器间的相互作用在细胞中发挥着重要作用。对MCSs的定量分析揭示了在各种生理和病理条件下细胞反应。然而,目前还缺乏一种有效的定量分析工具,在这种背景下,作者就开发了DeepContact,一种用于优化细胞器分割和接触分析,基于无标签EM的深度学习协议。DeepContact在交互式可视化方面具有高效率和灵活性,能适应细胞器的新形态,并能识别多种宽度范围内的接触,从而能对多个系统中各种类型的MCS进行统计分析。
2023-09-13 21:36:20
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原创 【算法可视化】数据结构与算法可视化网站
【VisuAlgo】数据结构和算法动态可视化https://visualgo.net/zh【Data Structure Visualizations】https://www.cs.usfca.edu/~galles/visualization/Algorithms.html【Algorithm Visualizer】(提供java、c++、js代码)https://algorithm-visualizer.org/...
2021-03-26 20:41:57
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原创 JAVA参考网页
Java参考网页整体整体【Howj2】 Java基础教程https://how2j.cn/【廖雪峰】Java教程https://www.liaoxuefeng.com/wiki/1252599548343744/1255876875896416
2021-03-07 21:50:42
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原创 【VSCode】 : launch.json常用属性
launch.json常用的具体含义如下:${workspaceRoot}the path of the folder opened in VS Code(VSCode中打开文件夹的路径)${workspaceRootFolderName}the name of the folder opened in VS Code without any solidus (/)(VSCode中打开文...
2020-03-09 20:26:47
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空空如也
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