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生物学
终是蝶衣梦晓楼
生物数据分析or生物软件开发or机器学习理论or嵌入式系统移植or英美语言文学
目前正致力于某生物数据可视化软件编写
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python解决序列重叠问题
注:如果你需要去重的格式不为blast tabular,简单的利用一些工具如awk/sed/perl/python/shell各种改变格式就好,只需要第二列的id,第九列的序列起始,第十列的序列结束,第十二列的得分有意义,作为排序用到的字段,其余字段都可缺省。对HSP区域的延伸要考虑基因的长度以及目标基因组scafflod or chromosome长度,不是一件容易的事情。去重叠的原理在于先排序,然后判断前一区间的末尾是否小于后一区间开始,若为假则重叠,根据长度/得分来判断删除前一区间还是后一区间。原创 2024-03-28 15:19:22 · 598 阅读 · 0 评论 -
用python实现隐马尔科夫(HMM)
【代码】用python实现隐马尔科夫(HMM)原创 2023-12-24 15:15:34 · 469 阅读 · 0 评论 -
Ruger_etal_2020
【代码】Ruger_etal_2020。原创 2023-11-16 20:46:36 · 95 阅读 · 0 评论 -
Linux返回上级目录命令
dbh^0.62;1 ha1cm。原创 2023-11-16 20:45:31 · 204 阅读 · 0 评论 -
Linux返回上级目录命令
原创 2023-10-25 19:22:25 · 129 阅读 · 0 评论 -
生命科学前沿作业答案1
结果显示,SguaOBP12与多种化合物(如longifolene、β-caryophyllene、α-pinene、β-pinene、myrcene、butylated hydroxytoluene和3-carene)有较高的结合亲和力。研究者首次从S. guani的触角转录组和基因组数据中鉴定出了14种OBP基因。分子生物学实验(如实时定量PCR,即RT-qPCR)被用来测试这14种OBPs的表达情况,结果显示SguaOBP2、5、6、11、12和13在雌性触角中的表达水平特别高。原创 2023-09-18 17:26:32 · 76 阅读 · 0 评论