盛普IDDNU研究团队靶向新冠病毒药物虚拟筛选综述
一、新型冠状病毒COVID-19感染作用机制
新型冠状病毒是一种RNA病毒,主要由蛋白质外壳和其遗传物质构成,如下图所示,新型冠状病毒上的突刺糖蛋白(Spike蛋白)会与细胞表面的ACE2受体结合,通过细胞内吞的途径进入细胞。病毒侵入宿主细胞后,会褪去蛋白质外壳,在细胞内释放病毒单链的正链RNA,在宿主细胞核糖体的作用下,翻译出病毒聚合酶,病毒聚合酶会进行病毒RNA的转录,并且以这些RNA翻译出病毒的非结构区域的肽,由宿主细胞内的酶水解成多个非结构蛋白,同时RNA依赖的RNA聚合酶会对病毒RNA进行大量的复制,并且翻译出大量的病毒结构蛋白,然后病毒会在细胞体内将病毒RNA、病毒非结构蛋白、病毒结构蛋白进行打包,进而形成成熟的病毒,通过外排作用使病毒进一步的扩散。
二、抗新型冠状病毒靶标选定:
团队对新型冠状病毒COVID-19感染作用机制进行病理生理学分析,对PDB数据库①中目前所有的389个COVID-19相关X射线衍射结构进行收录,对现阶段已明确的新型冠状病毒药物可能产生治疗作用的靶标进行研究,将以下3种作用位点作为药物研发的靶标,进行药物筛选和设计:
1.靶向ACE2受体