R语言安装包,安装Github包的三种方法

以安装Github上的Achilles包为例进行安装说明。

描述

1.安装包路径:https://github.com/OHDSI/Achilles#getting-started

2.该包功能:进行临床表征分析

R语言包安装过程总结:

第一步:环境准备

前提条件

1.安装jdk环境变量

2.配置R语言环境变量

install.packages("devtools")
install.packages("rJava")
library(rJava)
library(devtools)
library(usethis)
library(rJava)###java环境变量配置

参考资料网站:https://blog.csdn.net/tandelin/article/details/94580789

第二步:安装R语言包

【注意】进行第二步的前提条件是第一步的环境准备都已经完成了。

方法一:网络在线安装github包

(1)加载安装包

install.packages("devtools")
install.packages("rJava")
library(rJava)
library(devtools)
library(usethis)
library(rJava)###java环境变量配置
devtools::install_github("OHDSI/Achilles")

如果下面的library命令能加载执行,则说明包安装成功。

library(Achilles)
library(DatabaseConnector)
方法二:从github上下载zip包后离线手动安装
install.packages("devtools")
install.packages("rJava")
library(rJava)
library(devtools)
library(usethis)
devtools::install_local("C://Users//TD//Desktop//Achilles-master.zip")  #镜像选择all-- 1

离线包安装参考资料为:https://blog.csdn.net/tandelin/article/details/88768770
zip包下载路径:https://github.com/OHDSI/Achilles#getting-started

方法三:将其它电脑环境中安装好的library,包含这个包的library进行压缩zip,再将压缩好的zip进行相应的替换(替换时需要关闭R和Rstudio),就可使用。替换前还是要先执行下面的命令。
install.packages("devtools")
install.packages("rJava")
library(rJava)
library(devtools)
library(usethis)
方法四:本地离线下载安装

在这里插入图片描述

微信:realtimedata

R软件的介绍 R是一个开放的统计编程环境,是一种语言R语言是从S语言演变而来的。S语言是二十世纪70年代诞生于贝尔实验室,由Rick Becker, John Chambers, Allan Wilks开发。基于S语言开发的商业软件Splus,可以方便的编写函数、建立模型,具有良好的扩展性,取得了巨大成功。1995年由新西兰Auckland大学统计系的Robert Gentleman和Ross Ihaka,编写了一种能执行S语言的软件,并将该软件的源代码全部公开,这就是R软件,其命令统称为R语言。R是开源软件,代码全部公开,对所有人免费。R可在多种操作系统下运行,如Windows, Li~和UNIX等。R需要输入命令,可以编写函数和脚本进行批处理运算,语法简单灵活。目前在R网站上约有两千多个程序,涵盖了基础统计学、社会学、经济学、生态学、地理学、医学统计学、生物信息学等诸多方面。 R的获取与安装 R诞生于the University of Auckland的统计系。The Comprehensive R Archive Network简称CRAM,提供下载安装程序和相应软件。 R主页http://www.r-project.org/a下载:CRAM,选择镜像(如:http://cran.cnr.berkeley.edu/ ),选择操作系统(Linux,Windows或MacOS)。 以下简述R FOR WINDOWS的安装和使用: 在R主页下可以找到R的各个版本的安装程序和源代码。点击进入:Windows (95and later),再点击:base,下载SetupR.exe,约18兆,此便是R FOR WINDOWS的安装程序。双击SetupR.exe,按照提示一步步安装即可。 安装完成后,程序会创建R程序组并在桌面上创建R主程序的快捷方式(也可以在安装过程中选择不要创建)。通过快捷方式运行R,便可调出R的主窗口。 类似于许多以编程方式为主要工作方式的软件,R的界面简单而朴素,只有不多的几个菜单和快捷按钮。快捷按钮下面的窗口便是命令输入窗口,它也是部分运算结果的输出窗口,有些运算结果则会输出在新建的窗口中。 主窗口上方的一些文字是刚运行R时出现的一些说明和指引。 文字下的:>符号便是R的命令提示符,在其后可输出命令;>后的矩形是光标。R一般是采用交互方式工作的,在命令提示符后输入命令,回车后便会输出结果。 在R朴素的界面下,是丰富而复杂的运算功能。 附加安装 install. packages(package name, dependencies=TRUE) Windows下可以用菜单Packages--} Install package(s)安装 版本的更新 主程序:Windows下面只能卸载再安装 程序:update.packages() RStudio R语言可以独立运行,但是Rstudio作为R附加的GUI,有效的划分功能区,使输入和输出更为方便。 RStudio是可以在Mac OS X, Linux和Windows上运行在R编程语言中的生产力和灵活的用户界面。是一个自由和开源编程语言和环境,提供了大量的图形和统计方法统计计算和图形。从中可以快速方便地访问各种生产力工具的面向用户的界面。RStudio是一个非常实用的R语言的IDE,是一个免费的软件,特别是其服务器软件,可以将其构建在Linux服务器上,然后通过远程网页登陆访问,使得R语言的使用获得了极大的方便,也可以说是一个小小的云服务。
R语言中,你可以使用不同的方法来下载和安装包。以下是几种常见的方法: 1. 使用install.packages()函数:这是R语言中最常用的方法之一。你可以在R控制台中输入install.packages("package_name")来下载和安装指定的。例如,如果你想安装tidyverse,你可以输入install.packages("tidyverse"),然后按下回车键即可开始下载和安装。 2. 使用devtools:如果你想下载和安装Github上的R,你需要先安装devtools。你可以使用install.packages("devtools")命令来安装devtools安装完成后,你可以使用devtools::install_github("package_name")命令来下载和安装指定的Github上的R。请确保将"package_name"替换为你要安装的实际的名称。 3. 使用CRAN镜像:CRAN是R语言的官方存储库。你可以使用install.packages()函数来从CRAN下载和安装包。默认情况下,R会使用默认的CRAN镜像来下载。如果你想使用其他CRAN镜像,你可以使用options(repos = "镜像地址")命令来设置镜像地址,然后再使用install.packages()函数来下载和安装包。 请注意,以上方法只是下载和安装R的几种常见方法之一。根据你的具体需求和环境,可能还有其他方法可供选择。 #### 引用[.reference_title] - *1* *2* [R语言学习之R程序安装](https://blog.csdn.net/bgicollege/article/details/113660378)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^koosearch_v1,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item] - *3* [R语言—如何下载和使用](https://blog.csdn.net/Mrrunsen/article/details/122715708)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^koosearch_v1,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item] [ .reference_list ]
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