以安装Github上的Achilles包为例进行安装说明。
描述
1.安装包路径:https://github.com/OHDSI/Achilles#getting-started
2.该包功能:进行临床表征分析
R语言包安装过程总结:
第一步:环境准备
前提条件
1.安装jdk环境变量
2.配置R语言环境变量
install.packages("devtools")
install.packages("rJava")
library(rJava)
library(devtools)
library(usethis)
library(rJava)###java环境变量配置
参考资料网站:https://blog.csdn.net/tandelin/article/details/94580789
第二步:安装R语言包
【注意】进行第二步的前提条件是第一步的环境准备都已经完成了。
方法一:网络在线安装github包
(1)加载安装包
install.packages("devtools")
install.packages("rJava")
library(rJava)
library(devtools)
library(usethis)
library(rJava)###java环境变量配置
devtools::install_github("OHDSI/Achilles")
如果下面的library命令能加载执行,则说明包安装成功。
library(Achilles)
library(DatabaseConnector)
方法二:从github上下载zip包后离线手动安装
install.packages("devtools")
install.packages("rJava")
library(rJava)
library(devtools)
library(usethis)
devtools::install_local("C://Users//TD//Desktop//Achilles-master.zip") #镜像选择all-- 1
离线包安装参考资料为:https://blog.csdn.net/tandelin/article/details/88768770
zip包下载路径:https://github.com/OHDSI/Achilles#getting-started
方法三:将其它电脑环境中安装好的library,包含这个包的library进行压缩zip,再将压缩好的zip进行相应的替换(替换时需要关闭R和Rstudio),就可使用。替换前还是要先执行下面的命令。
install.packages("devtools")
install.packages("rJava")
library(rJava)
library(devtools)
library(usethis)
方法四:本地离线下载安装
微信:realtimedata