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原创 散点图+箱式图+小提琴图三图叠加的分组差异分析图绘制

我们使用散点图+箱式图+小提琴图三种图形叠加在一起更全面详细地展示不同分组数据的分布情况。我编写了一个命令行下一键作图R语言脚本,不需要R语言基础的也可以用这个脚本直接进行进行作图

2022-09-13 02:18:55 3025 1

原创 差异分析的结果各种热图,火山图,箱式图可视化作图教程

大家看了我整个GEO分析流程的系统讲解视频+每个模块的实操讲解视频+每个模块的演示数据,这样下来基本上一天就能精通GEO的全流程分析,并能快速用自己的GEO测序数据或公共数据库下载的GEO数据在自己的电脑上跑完GEO分析的全部流程。包括但不限于GEO数据的全流程零代码一键分析软件神器OmicsTools在我的github仓库zihaoxingstudy1/OmicsTools仓库中,大家可以下载安装进行各种生信分析和可视化作图。

2024-07-17 15:53:04 334

原创 GEO数据挖掘从数据下载处理质控到差异分析全流程分析步骤指南

大家看了我整个GEO分析流程的系统讲解视频+每个模块的实操讲解视频+每个模块的演示数据,这样下来基本上一天就能精通GEO的全流程分析,并能快速用自己的GEO测序数据或公共数据库下载的GEO数据在自己的电脑上跑完GEO分析的全部流程。包括但不限于GEO数据挖掘的全流程零代码一键分析软件神器OmicsTools在我的github仓库zihaoxingstudy1/OmicsTools仓库中大家可以下载安装进行各种生信分析和可视化作图。

2024-07-14 23:39:06 1344

原创 GEO的表达矩阵的探针ID转换成基因名称教程

在基因表达数据分析中,了解特定的基因探针平台(GPL)的注释信息是非常重要的。`GEO`,或者称为`Gene Expression Omnibus`,是一个存储高通量基因表达数据(如微阵列和次世代测序数据)的公共数据库,由美国国立生物技术信息中心(NCBI)管理。每个数据集通常与一个或多个探针平台相关联,这些平台在GEO中被指定为GPL(Gene Expression Omnibus Platform)。

2024-07-12 18:17:33 1073

原创 转录组和基因芯片GSE数据RAW.tar压缩包下载和多样本整合处理教程

大家看了我整个GEO分析流程的系统讲解视频+每个模块的实操讲解视频+每个模块的演示数据,这样下来基本上一天就能精通GEO的全流程分析,并能快速用自己的GEO测序数据或公共数据库下载的GEO数据在自己的电脑上跑完GEO分析的全部流程。包括但不限于GEO数据的全流程零代码一键分析软件神器OmicsTools在我的github仓库zihaoxingstudy1/OmicsTools仓库中,大家可以下载安装进行各种生信分析和可视化作图。

2024-07-11 18:18:07 734

原创 根据GEO的GSE数据集编号自动下载和处理GEO数据教程

NCBI GEO数据库(Gene Expression Omnibus)是一个全球最大的生物医学领域的公共数据库平台,用于存储基因组学数据,包括基因表达数据、染色质状态和基因组变异等。研究人员可以在该平台上查找、下载和分析各种基因表达数据集,以便进行生物信息学和生物医学研究。NCBI GEO数据库提供了丰富的数据资源和分析工具,是生命科学领域的重要研究工具之一。大量生物医学领域发表的论文使用的公共数据集也一般是来自GEO数据库的数据集。

2024-07-10 15:24:46 846

原创 OmicsTools新增了22种发表级的配色方案

我开发的本地电脑无限使用无限分析作图的生信零代码一键分析电脑软件神器OmicsTools 软件在github上的zihaoxingstudy1/OmicsTools仓库中,大家可以下载安装OmicsTools进行各种生信分析和可视化作图。也可以到我的生信交流qq群931846486的群文件中下载到OmicsTools分析软件,大家可以下载安装OmicsTools进行各种生信分析和可视化作图。

2024-05-25 12:12:21 369

原创 OmicsTools的答疑和用户评价

我更新的在本地电脑无限使用无限分析作图的生信零代码一键分析电脑软件神器OmicsTools新版本软件都可以到我的zihaoxingstudy1/OmicsTools github仓库中下载,也可以到我的生信交流qq群931846486的群文件中下载到OmicsTools分析软件,大家可以一直下载安装更新的OmicsTools软件进行各种生信分析和可视化作图。

2024-05-24 09:15:36 299

原创 OmicsTools的R语言分析环境配置教程效果示意图

我开发了一款本地电脑无限使用的零代码生信数据分析作软图神器电脑软件OmicsTools,欢迎大家使用OmicsTools进行生物医学科研数据分析和作图,该软件件能让大家在不需要任何编程和代码编写的基础上,分析次数没有限制,可以无限使用,让您在自己的电脑上快速进行大量的生信分析和加速大家的科学研究。软件下载。

2024-05-23 12:03:01 2134

原创 零代码进行单细胞数据全流程分析教程

我开发的本地电脑无限使用无限分析作图的生信零代码一键分析电脑软件神器OmicsTools 软件在github上的zihaoxingstudy1/OmicsTools仓库 中,大家可以下载安装OmicsTools进行各种生信分析和可视化作图。

2024-05-14 18:58:42 1101 1

原创 单细胞聚类后的所有cluster差异分析

我开发的本地电脑无限使用无限分析作图的生信零代码一键分析电脑软件神器OmicsTools 软件在github上的zihaoxingstudy1/OmicsTools仓库 中,大家可以下载安装OmicsTools进行各种生信分析和可视化作图。

2024-05-12 18:35:26 811

原创 一次性帮所有R语言新手解决各种R包安装报错安装不上的问题

一次性帮R语言新手解决各种R包安装报错安装不上的问题,再也不用每次花钱找人远程帮你安装各种报错的R包

2024-05-09 18:56:15 414 1

原创 挑选最好的分辨率resi,进行分群结果的可视化

我开发的本地电脑无限使用无限分析作图的生信零代码一键分析电脑软件神器OmicsTools 软件在github上的zihaoxingstudy1/OmicsTools仓库 中,大家可以下载安装OmicsTools进行各种生信分析和可视化作图。

2024-05-03 18:35:49 590 1

原创 细胞cluster分群聚类教程和结果解读

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2024-05-02 18:41:52 39 1

原创 使用SingleR自动进行细胞注释教程

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2024-05-01 18:57:32 1859

原创 单细胞数据缩放和PCA降维分析教学教程

我开发了一款本地电脑无限使用的零代码生信数据分析作软图神器电脑软件OmicsTools,欢迎大家使用OmicsTools进行生物医学科研数据分析和作图,该软件件能让大家在不需要任何编程和代码编写的基础上,分析次数没有限制,可以无限使用,让您在自己的电脑上快速进行大量的分析。在本地电脑无限使用无限分析作图的生信零代码一键分析电脑软件神器OmicsTools 软件在github上的zihaoxingstudy1/OmicsTools仓库 中,大家可以下载安装OmicsTools进行各种生信分析和可视化作图。

2024-04-30 18:59:31 417

原创 单细胞测序分析的多样本整合和去除批次效应教程

我开发了一款本地电脑无限使用的零代码生信数据分析作软图神器电脑软件OmicsTools,欢迎大家使用OmicsTools进行生物医学科研数据分析和作图,该软件件能让大家在不需要任何编程和代码编写的基础上,分析次数没有限制,可以无限使用,让您在自己的电脑上快速进行大量的生信分析和加速大家的科学研究。

2024-04-29 18:32:37 468

原创 单细胞测序数据质控教程和结果解读

在本地电脑无限使用无限分析作图的生信零代码一键分析电脑软件神器OmicsTools 软件在github上的zihaoxingstudy1/OmicsTools仓库 中,大家可以下载安装OmicsTools进行各种生信分析和可视化作图。

2024-04-28 20:33:41 951 1

原创 在电脑上无限使用的零代码生信分析作图神器软件OmicsTools使用教程

我开发了一款本地电脑无限使用的零代码生信数据分析作软图神器电脑软件OmicsTools,欢迎大家使用OmicsTools进行生物医学科研数据分析和作图,该软件件能让大家在不需要任何编程和代码编写的基础上,分析次数没有限制,可以无限使用,让您在自己的电脑上快速进行大量的生信分析和加速大家的科学研究。

2024-04-27 18:30:18 313

原创 使用我开发的OmicsTools零代码进行单细胞测序数据分析可视化和细胞通讯分析系列教程

使用我开发的OmicsTools零代码进行单细胞测序数据分析可视化和细胞通讯分析系列教程我开发了一款本地电脑无限使用的零代码生信数据分析作软图神器电脑软件OmicsTools,欢迎大家使用OmicsTools进行生物医学科研数据分析和作图,该件能让大家在不需要任何编程和代码编写的基础上,分析次数没有限制,可以无限使用,让您在自己的电脑上快速进行大量的生信分析和加速大家的科学研究和发表sci论文。

2024-03-18 11:30:41 516

原创 R语言向量数据结构数据操作详细教程

R语言向量数据结构数据操作处理详细教程

2023-07-05 22:59:55 154 1

原创 自动批量安装加载cran, bioconductor和github三个平台的所有的R包

自动批量安装加载cran, bioconductor和github三个平台的所有的R包

2023-05-03 12:13:29 197

原创 散点图绘制

本文将给大家讲解在ggplot2中使用data,aes,geom_point三要素基本散点图的绘制,更改散点图的颜色,大小和形状,为相关性散点图添加趋势线, 分类聚类散点图的颜色,形状,大小,分组设置,散点图的批量文本注释,以及对散点图中部分点进行注释,让大家对各种散点图的分析作图绘制有全面清晰的掌握和了解

2022-10-12 22:12:42 360

原创 ggplot2学习使用教程

ggplot2中所有图表都由数据data、美学映射函数aes和图形展示方式geom_xxx函数所构成,有这三个要素的组合,就可以绘制一个基本的ggplot2图片,当然也可以在此基础上使用ggplot2的geom图层叠加, 文字,颜色,坐标轴名称更改等细节调整绘制更精美的图形

2022-10-01 23:14:14 438

原创 使用R语言中自带数据集进行快速分析作图和快速演示教学

我们使用python或R语言中自带的数据集,就不需要额外准备数据集,就能非常方便的学习,探索和演示数据分析的过程,而且其它用户也能使用同样的内置数据集,分析过程也能非常方便的复现我们想快速作图或做一些分析以及演示和教学,首先要准备数据集,很多R包中都有了一些内置的数据集,可以供我们直接使用作为我们学习一个R包的参考,ggplot2中也有一些内置数据集,我们不想准备数据集,只是想作为学习和演示使用的话,直接调用R包中的内置数据集就是最快最方便的方式了

2022-09-25 00:16:42 967

原创 R语言和Rstudio在linux系统下的安装使用和常见错误问题处理

跟大家详细介绍怎么在ubuntu linux系统中使用apt安装R语言,以及添加最新的R源,安装最新版本的R语言,以及在没有root权限的服务器上编译安装R语言,指定R包的安装位置,配置R包下载的镜像源来加速R包下载,常用R包安装和R语言一些保存的问题处理。

2022-09-21 01:42:16 1334

原创 Windows下Rstudio的下载安装步骤详解

本文跟大家详细讲解Rstudio的下载安装步骤,Rstudio是最强大的一个R语言的IDE (集成开发环境), 跟R语言的base软件的简陋的窗口不同,Rsutido有着漂亮的用户界面,丰富而强大的功能,在编写代码是有着强大的语法检查,智能提示,智能补全能功能,在运行代码时,也有详细的错误检查和报错提示,对于初学R语言的新手来说,使用Rstudio来编写R语言脚本是一个非常明智和舒服的选择。

2022-09-15 02:05:28 863

原创 R语言和Rtools的详细下载安装教程

本文跟大家非常详细讲解了怎么一步步下载国内镜像源的R语言base软件和R语言的拓展库Rtools, 以及怎么安装R和Rtools,并将R和Rtools添加到windows系统的环境变量下,方便大家在cmd命令行下使用R语言,可以作为大家安装使用R语言的一个十分详细的参考学习教程。

2022-09-14 02:12:50 3309

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