SimpleElastix安装及所遇问题（windows）

三大步骤：

1. 用CMake生成构建文件

1. 用Visual Studio编译器编译

1. 安装Python模块

看着这三步和把大象装冰箱分几步一样简单。然并简。在安装SimpleElastix前确认Python3.4已经安装。

下载并安装CMake以后，从git上下载SimpleElastix(https://github.com/kaspermarstal/SimpleElastix)。一定要从git上下载，不要从SimpleElastix的网页上下载zip包。否则会在编译时出现错误:

cl : Command line error D8021: invalid numeric argument '/Wno-long-double' [C:\Si\SimpleITK-build\CMakeFiles\CMakeTmp\cmTC_fa6e6.vcxproj]

仔细看了一下，两个内容是不大一样。zip是源代码。cmakelist也不一样。

在D盘新建一个文件夹，喜欢什么叫什么吧...然后cmake的原文件夹选择git下载的文件夹里的SuperBuild。生成文件夹就是刚才自己新建的文件夹

点configure出现选项：

Python是32位的选择Visual Studio 12 2013。再次点击configure，第一步完成。

打开Visual studio，选择文件->打开项目/解决方案->打开并选择SuperBuildSimpleITK.sln

或者直接文件夹双击SuperBuildSimpleITK.sln

选择release,右键点击ALL_BUILD，生成。等待编译器编译。大概需要4个小时。

编译过程中发生错误：LINK : fatal error LNK1102: out of memory 

原因：当我们选择64位编译器时，Visual Studio的目标平台是64位，但是Visual Studio工具链本身默认是32位的。因此，在链接阶段可能发生内存不足的错误。

解决方案:在命令提示符中设置环境变量IsNativeEnvironment=true，然后从命令行调用Visual Studio可执行文件，再进行编译。

set _IsNativeEnvironment=true
start "c:\Program Files (x86)\Microsoft Visual Studio 12.0\Common7\IDE\devenv.exe" D:\simEl\SuperBuildSimpleITK.sln

编译完成后在SimpleElastix安装目录下（例如D:\simEl\SimpleITK-build\Wrapping\Python\Packaging）中可以看到setup.py。

运行->cmd，进入安装目录\SimpleITK-build\Wrapping\Python\Packaging，输入python setup.py install，就将python模块安装上了。这时候在python IDLE中输入

import SimpleITK as sitk

resultImage = sitk.Elastix(sitk.ReadImage("fixedImage.nii"), \
                           sitk.ReadImage("movingImage.nii"), \
                           "translation")

就可以运行了。如果出现错误 ImportError: No module named '_SimpleITK'或者AttributeError: 'module' object has no attribute 说明没有Python模块没有安装好。

唉，出现这么多问题，真的折腾死。还是google好用。还好了，你遇到的问题基本上别人都遇到过。有错误就一个一个解决。总能搞定的