win10环境下 simpleElastix编译安装

最新推荐文章于 2024-04-17 09:52:15 发布
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分类专栏： 开发环境配置 文章标签： anaconda windows
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版权

官方安装说明
参考博客

本人机器配置

windows10，64位
Anaconda安装的python3.5，64位
VS 2019
CMake 3.16.5

安装过程

1. python
官网给了个python3.4的whl安装文件。用anaconda新建了一个虚拟环境，其python版本为3.4。在其中尝试直接pip安装官网给的whl文件，这个文件包含SimpleITK及simpleelastix的扩展，所以无需先安装simpleITK。安装过程顺利，但实际使用官网例子测试时，有模块未定义。猜测是版本过低的原因。后续使用的是root环境的python3.5。
不得不开始用VS CMake编译（That’s life. 哭）。

2. CMake
官网给出了一些Tips，例如所在路径不要太长。
2.1 设置源和目标路径后，点击configure，
2.2 编译器选择VS 2019；把第2项选则成×64
2.3 点击Finish之后，点击Generate。

3. VS2019编

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安装中其他问题参考https://blog.csdn.net/weixin_43975801/article/details/104927304 此外在完全编译完成提示成功后，也编译到python任然显示simpleitk 没有 Elastix attribute, 可以卸载一下SimpleITK试试，编译到python之后安装了另外一个版本的SimpleITK version 2.0.0+ggitdir.notfound， 可能这个和原版本的1.2.2打架了，卸载后就正常了 ...
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一.Elastix介绍 Elastix是一个基于ITK开发的处理医学图像配准问题的工具。Elastix提供了很方便的命令行使用方式以供使用者进行配准应用。 同时Elastix是开源的，并且采用模块式构成。可以根据源代码进行开发，或者添加新的模块。使用Elastix的源码需要遵循一些开源的规则，如果有使用需求，可以进行了解。 相关的使用文档:https://download.csdn.net/download/Joker00007/13757991 安装包及Github代码:https://download.
Elastix配准工具编译
风言风语
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Elastix是基于ITK的配准工具包，可以从官方网站下载到Elastix的源代码，进行编译使用，或者对源代码进行修改，满足不同的使用需求。
win10安装prophet需要安装编译环境吗
07-27
根据引用\[1\]中的信息，安装prophet需要先安装pystan。在Windows下安装pystan时，可以按照官方文档的建议使用conda进行安装。具体的安装步骤如下： 1. 打开命令行窗口，执行以下命令安装C++编译器：conda install libpython m2w64-toolchain -c msys2 2. 安装prophet的依赖库：conda install numpy cython matplotlib scipy pandas pystan -c conda-forge 3. 安装pystan：conda install pystan -c conda-forge 4. 安装prophet：pip install fbprophet 根据引用\[3\]中的信息，也可以直接使用conda进行安装：conda install fbprophet -c conda-forge。这种方式会自动安装pystan的依赖。 需要注意的是，根据引用\[2\]中的描述，安装过程可能会遇到一些问题，例如python停止工作的窗口。在这种情况下，可以尝试卸载并重新安装另一个版本的anaconda，或者安装Visual Studio 2015等C++编译环境。 总结起来，安装prophet时需要安装pystan和其它一些依赖库，具体的安装步骤可以根据引用中提供的信息进行操作。 #### 引用[.reference_title] - *1* *3* [win7 安装prophet](https://blog.csdn.net/g1027785756/article/details/96327424)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^control_2,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item] - *2* [历时5天，终于安装好prophet！](https://blog.csdn.net/weixin_47966757/article/details/109419084)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^control_2,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item] [ .reference_list ]

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