R数据分析:孟德尔随机化中介的原理和实操二

delta方法

上面的流程跑通之后,对于中介分析,我们需要报告间接效应的估计值和置信区间,还有中介比例的估计值和置信区间,类似下面的这样:

但是其实我们是光跑孟德尔是得不到上面的需要的值的(比如间接效应的标准误,中介比例的标准误),此时需要借助的方法之一叫做delta method。

As individual level data is not available in summary data MR, bootstrapping cannot be used to estimate the confidence intervals for the indirect effect or proportion mediated, but the delta method can be used to approximate these confidence intervals if samples are independent

delta method可以帮助我们得到ab相乘的标准误,从而算出中介效应的置信区间。

也就是说我们知道了A,B路径的点估计和标准误,根据上面的公式就可以得到间接效应的置信区间,在R中实现起来也容易的,使用RMediation包,这个包作者有开发shiny应用,输入A,B的估计值和标准误就可以得到间接效应的估计值和标准误和置信区间了(下图圈内):

bootstrap方法

bootstrap方法也可以用来帮助我们计算中介效应和中介比例的置信区间:

Bootstrapping is a techniq

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