R数据分析：tableone包的详细使用介绍

tableone是帮助我们快速生成文章中table1表格的一个包，通常来说一篇SCI文章的第一个表都会给出样本的基线情况。而tableone就是可以帮我们快速地汇总描述所有样本的基线变量的一个包。

今天就给大家写写tableone，其实还有一个包叫做table1，功能差不多，以后给大家写。

实例解析

还是写一个例子帮助大家理解，用到的数据是R自带的pbc数据集。这个数据集是梅奥诊所收治的肝硬化病人的数据，共424个。

This data is from the Mayo Clinic trial in primary biliary cirrhosis (PBC) of the liver conducted between 1974 and 1984. A total of 424 PBC patients, referred to Mayo Clinic during that ten-year interval, met eligibility criteria for the randomized placebo controlled trial of the drug D-penicillamine。

这个数据集大概长这样：

 

现在我想要看看整个数据集的描述性分析，那么我就可以：

CreateTableOne(data = pbc)

输出如下：

 

看到没，所有的数值变量都给你以均值标准差的形式描述好了，因子变量频数百分比也描述好了，不用你再用什么SPSS一个一个来描述统计了。

等等，问题还是有滴，比如：

• 数据库中其实有很多变量应该是因子类型的，但是都给整成整数型了
• 连ID都给描述了，这玩意我不需要

我们来调整一下，比如我论文中只需要描述如下的变量：