针对 “单flow含100个有依赖的轻量job”运行异常的案例分析

摘要: 在作业调度某次性能测试开展中,用例“一个工作流中存在100个有相互依赖关系的轻量job”运行异常,经过层层分析,最终发现是运行job的机器unable to create new native thread触发了spark2.0版本的一个bug,并通过修改了最大线程数最终完成了该用例测试执行。

1、案例介绍

        在作业调度某次性能测试开展中,用例“一个工作流中存在100个有相互依赖关系的轻量job”运行异常,详情如下:在测试执行过程中,从portal前端任务调度/数据分析/查看运算元素界面,观察到部分job执行成功,少量job一直处于执行中状态(正常场景下单个job从提交到执行完毕大约耗时2分钟左右,这部分少量的job处于执行中的时间远大于2分钟),大部分job处于等待中状态。

100个job的依赖关系在作业调度界面的DAG图如下(看起来很复杂、很杂乱):

梳理后的DAG图:

2、问题分析

发现用例执行异常后,便开展排查和分析的工作。首先要排除是测试人员误操作引起的非问题,排除误操作后方可对用例运行的日志进行系统分析。

2.1、排除测试人员误操作

     用例执行的job是将数据从HDFS导入至HIVE库中的表,HDFS以及HIVE表虽然是通过脚本批量创建的,但是也不能排除误建的可能性。因此需要检查对应job执行过程中源文件与目标表是否存在且满足需求。

       为了检查对应job执行过程中源文件与目标表是否存在且满足需求,则需查看job对应的配置信息,才确定job对应的源文件与目的表。在性能测试过程中,界面上很难查看单个job的配置信息,可以通过数据库查询。具体步骤略;

     通过获取到的源数据的路径与目标表名称,检查HDFS上的文件与hive库中的表是否存在、类型是否满足测试需求等等,步骤略;

     通过检查,确认ETL的源文件与目标表均存在,通过以上步骤排除测试人员的测试误操作,然后对用例执行过程中的日志文件进行分析。

2.2日志文件分析

      进行日志文件分析前,必须了解用例执行过程中的应用服务的内部逻辑。内部逻辑步骤以及每个步骤关联的日志如下表:

逻辑步骤

对应日志文件及检查点

1、作业调度的server端接受前端job任务后,将任务放到zk指定目录下

Server端日志

2、agent端定时去zk的目录下获取job任务。

Agent端日志

3、agent获取到job任务后,将任务提交到yarn上。

Yarn上accept的任务列表

4、yarn根据job指定的资源完成资源分配。

Yarn上running的任务的资源分配日志

5、通过spark进行任务执行

Executor的执行日志

6、完成任务执行后,agent回传执行情况至zk指定目录

Agent端日志

7、server端定时去指定目录获取已经执行完毕的job信息,回传至前端显示。

Server端日志

        通过章节一中的案例介绍,前端界面上显示部分job已经处于运行中的状态,即agent端已经获取到了job,因此,我们直接跳至上表中的步骤3查看job是否提交至yarn上。

 2.2.1、Yarn running列表查看

有两种方法可以查看yarn上的任务列表。1、通过vnc界面的查看。这种的方式比较直观。2、通过命令行进行查看,下面分别介绍这两种方法。

2.2.1.1  vnc查看yarn任务列表

使用vnc,首先要进行下载、安装,下载、安装步骤略。

完成安装后,需要输入访问的ip和用户名/密码方能登录(ip和用户名/密码为当前处于active节点的ip),在浏览器重输入链接:n1.dsj.migu.cn:50030/cluster。

链接并非一层不变的,其中n1.dsj.migu.cn为处于active的节点的主机别名。为了获取这个链接,首先我们需要查看namenode的状态。

1、查看namenode的状态命令: hdfshaadmin -getServiceState nn1。

其中nn1为namenode的名称,在hdfs-site.xml中进行配置。那怎么得到namenode的名称呢?

在linux界面输入:vim $HADOOP_HOME/etc/hadoop/hdfs-site.xml,如下图所示:

2、然后在该节点上,通过/etc/hosts文件可以查看处于active的节点的主机别名。如下图:

2.2.1.2 命令行查看

在linux命令行输入:yarn application –list,可以查看application相关信息

打开yarn的链接后,发现界面上显示运行中的job已经处于yarn的running列表中。因此,继续检查逻辑步骤4---yarn资源分配是否正常。

2.2.2  yarn资源分配检查

通过排查container的日志,可以查看资源分配以及使用的情况。同样有两种方式可以查看container的日志。1、通过vnc界面连接。2、linux的命令行,下面分别介绍这两种方式。

2.2.2.1  vnc查看yarn任务的资源分配

查看对应yarn上的running任务,发现执行中的任务在yarn上一直处于running状态,可知在调度界面上显示处于运行中的job已经提交到yarn上了。通过界面点击logs查看资源分配的日志,如下图中的“logs”。

2.2.2.2  命令行查看

通过命令行:yarn application –list可获取applicationId,然后在命令行上输入yarn logs -applicationId applicationId可查看对应执行序列号为applicationId的资源相关日志。

类似日志如下:

Container [pid=134663,containerID=container_1430287094897_0049_02_067966] is running beyond physical memory limits. Current usage: 1.0 GB of 1 GB physical memory used; 1.5 GB of 10 GB virtual memory used.

通过以上日志可以看出使用内存小于分配内存,说明内存资源没有出现问题。

通过步骤4未发现异常,继续检查步骤5---spark执行日志是否存在异常。

2.2.3  spark执行日志

         接下来查看spark的执行日志,即executor的日志,查看是否存在异常。

正在运行的job可以通过点击界面上的日志链接查看日志。点击界面上的executor标题,选择处于卡顿状态的executor日志。查看spark运行executor的日志(可理解为线程),可以看到日志中报错。

百度spark的报错,发现此错误为spark2.0版本已有的bug,并在spark2.1版本中进行了修复。

继续分析是什么场景暴露了spark2.0版本的bug,查看一直处于运行中的job的日志中可以看到,报错java.lang.OutofMemoryError:unable to create new native thread。

对比日志出现的时间,可知java.lang.OutofMemoryError:unable to create new native thread触发了spark的报错。

2.2.4  java.lang.OutofMemoryError异常分析

         关于java.lang.OutofMemoryError:unable to create new native thread的报错,这个异常问题的本质原因是用例在运行过程中创建了太多的线程,而能创建的线程数是有限制的,导致了异常的发生(百度)。总结了一下,可能的导致错误的原因有三个,具体如下:

  1. linux系统问题----在linux上每个用户能够创建的线程数量是有最大值的,最大值通过ulimate–a 命令行可以查看,不同的用户max user processes可能不同;

   2.jvm内存配置问题----能创建的线程数的具体计算公式如下:

(MaxProcessMemory - JVMMemory - ReservedOsMemory) / (ThreadStackSize) = Number of threads

MaxProcessMemory 指的是一个进程的最大内存;

JVMMemory         JVM内存

ReservedOsMemory  保留的操作系统内存

ThreadStackSize      线程栈的大小

你给JVM内存越多,那么你能创建的线程越少,越容易发生以上错误。

3、程序问题----程序内部有bug,导致创建大量不需要的线程或者线程没有及时回收,那么必须解决这个bug,修改参数是不能解决问题的,当然如果程序确实需要大量的线程,现有的设置不能达到要求,那么可以通过修改MaxProcessMemory,JVMMemory,ThreadStackSize这三个因素,来增加能创建的线程数;

验证是哪一种原因的影响,建议采用按照1、2、3点的顺序来排查。

3、修改验证

3.1 修改linux最大线程数

下面先进行问题1排查。Linux可创建线程的最大值可通过ulimate–a 命令行可以查看用户wangxin以及hadoop用户的最大线程数(wangxin的账号为portal前端登录的账号,也是spark上提交spark任务的用户,hadoop用户为基础平台内部创建线程时使用的用户),发现最大线程数为1024,在该用例运行过程中,很可能不够。因此,我们进行线程数的修改。

修改步骤如下:

1、使用root用户修改配置文件:/etc/security/limits.conf

增加如下内容

* softnproc65535

* hardnproc65535

“*”代表了所有用户

2、修改/etc/security/limits.d/90-nproc.con

将* softnproc 1024修改为:* softnproc65535

但须注意,修改系统的线程数后,很容易出现修改了却未生效的情况,需要通过重连会话、切换用户来检查修改是否生效。那么如何检查配置是否生效呢?

断开当前会话,重新连接,随意选择登陆用户,输入命令:ulimit–a,查看最大线程数是否为修改后的个数,如未生效,则为ssh配置的问题,需联系运维人员进行处理。

3.2 验证执行

完成修改后,将用例进行重新运行,未出现如上错误,证明确实是linux用户的最大线程数造成的问题。但是仍然有2个job未执行成功,分别对未执行成功的job进行配置检查以及日志分析。

1、对比异常的日志与正常执行的日志(推荐工具:beyond compare),可以看到异常的日志中未进行transload这个步骤,并对比其他的正常日志的日志,发现异常日志中totalRows为0,检查配置ETL_HY_DTHIVE_101所对应的源文件test000不存在,但是etl执行并不会报错,作业调度前端也显示成功,但是去执行的日志可以看到,日志逻辑与正常执行的逻辑不一样,并没进入spark执行,属于配置错误。

异常的job执行日志:

正常的执行日志:

2、job对应的配置编号为ETL_HY_DTHIVE_102的日志中提示,hive表下的文件Test000.txt未非列式文件。因此考虑是否是该配置对应的表有异常,因此手动进行hive,查看表的内容,提示hive表下的文件Test000.txt未非列式文件。猜测是测试人员在调试脚本或准备数据过程手动load过非列式文件,所以etl执行时出错。清空表,再执行job,job执行成功。

因此测试过程中,需要对构造的数据的边界数据进行重点检查,比如构造的数据为Test000.txt--Test099.txt,需要重点检查Test000、Test099的值。

4、测试工作方法积累

1、出错时,对比正确执行的日志可知哪一步开始出错;

2、在性能测试时检查数据抽样检查容易出错。可采用程序校验的方式进行数据库数据的批量检查,也可通过提前选用特殊的标记字段,通过数据库查询语句检查插入的数据条数。

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