Jbrowse中Alignment track的具体配置方法

需要将配置信息配置在tracks.conf文件当中。

具体配置用例:

[ tracks . Sclera-2days-fellow ]
style.height = 7
key = BAM - Sclera-2days-fellow.bam
storeClass = JBrowse/Store/SeqFeature/BAM
urlTemplate = data/Sclera-2days-fellow.bam
maxFeatureScreenDensity = 4
metadata.category = Tissue /Sclera/RNAseq
type = JBrowse/View/Track/Alignments2

properties:

baiUrlTemplate  .bam文件的索引文件,当没有配置的时候,默认为【.bam的文件名称+.bai】    当没有.bai文件的时候,可以通过samtools软件根据.bam文件生成相应的.bai文件

urlTemplate  .bam文件的路径



  • 0
    点赞
  • 0
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值