需要将配置信息配置在tracks.conf文件当中。
具体配置用例:
[ tracks . Sclera-2days-fellow ]
style.height = 7
key = BAM - Sclera-2days-fellow.bam
storeClass = JBrowse/Store/SeqFeature/BAM
urlTemplate = data/Sclera-2days-fellow.bam
maxFeatureScreenDensity = 4
metadata.category = Tissue /Sclera/RNAseq
type = JBrowse/View/Track/Alignments2
properties:
baiUrlTemplate .bam文件的索引文件,当没有配置的时候,默认为【.bam的文件名称+.bai】 当没有.bai文件的时候,可以通过samtools软件根据.bam文件生成相应的.bai文件
urlTemplate .bam文件的路径