python-igraph基本用法（一）

从边列表文件生成网络

　　按照边列表的形式读入文件，生成无向图。

# -*- coding: utf-8 -*- #设置中文注释
import igraph as ig

#按照边列表的形式读入文件，生成无向图

g = ig.Graph.Read_Edgelist("com-youtube.ungraph.txt", directed=False)

基本信息

 ecount = g.ecount()#统计边的数目
 vcount = g.vcount()#统计节点数目
 maxdegree = g.maxdegree()#最大度值

计算度序列

　　degree()函数生成度序列

import igraph as ig

#按照边列表的形式读入文件，生成无向图
g = ig.Graph.Read_Edgelist("com-youtube.ungraph.txt", directed=False)

degrees = g.degree()#列表
#序列化度序列
# f = open("youtube_degree.txt", 'w+')
# for d in degrees:
#     print >> f,"%d" % d

类似效果：

29
256
12
2753
192

生成边列表文件

　　get_edgelist()函数生成边列表文件，该函数可以将内存中的网络整理成边列表形式

#序列化边信息
edgelist = g.get_edgelist()
f = open("youtube_edgelist.txt", 'w+')
for edge in edgelist:
    print >> f,"%d\t%d" % edge

类似效果：

1   2
1   3
1   4
1   5
1   6
1   7
1   8

邻居节点信息

给定节点

　　给定节点编号，求得其所有的邻居节点

neighbors = g.neighbors(vertex=1)
f = open("youtube_data.txt", 'w+')
try:
    for neighbor in neighbors:
        print >> f,"%d" % neighbor
finally:
    f.close()

类似结果：

[2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 376, 1219, 268635, 317880, 665255, 665256, 665257, 665258]

所有节点

　　按照节点编号顺序依次列出所有的邻居节点，其中这列节点的标号顺序可以看做网络中边的编号。

import igraph as ig

g = ig.Graph.Read_Edgelist("com-youtube.ungraph.txt", directed=False)

# ig.Graph.neighborhood()
neighbors = g.neighborhood()
# print type(neighbors)

f = open("youtube_data.txt", 'a+')
try:
    for list in neighbors:
        for neighbor in list[1:]:#第一个元素是当前节点，其余元素是该节点的全部邻居节点
            print >> f,"%d" % neighbor
finally:
    f.close()

数据连接：
http://snap.stanford.edu/data/bigdata/communities/com-youtube.ungraph.txt.gz