使用Matlab和Minepy工具箱做变量的互信息MIC (maximal information coefficient ) 分析

本文介绍了在Windows环境下,如何在Matlab R2018中使用Minepy库进行变量的互信息(MIC)分析。详细步骤包括下载与安装Minepy,配置Matlab路径,以及解决编译问题。成功安装后,可在Matlab中运行示例代码,获取最大信息系数(MIC)、最大不对称分数(MAS)等结果。
摘要由CSDN通过智能技术生成

环境: Windows, MatlabR2018

Minepy是一个可以计算互信息的库,matlab中使用需要安装该库

Minepy的说明及安装步骤详见官方文档:

https://minepy.readthedocs.io/en/latest/install.html#octave-users-windows-linux-and-mac-os-x

下面梳理一下笔者的安装步骤:

1.下载库  网址: https://github.com/minepy/minepy/releases  下载最新版 minepy-1.2.4.tar.gz 即可

2. 解压 minepy-1.2.4.tar.gz 文件,并将其放到某一个路径D:/xxxxx 下

3. 打开matlab 并且把当前路径变成D:/xxxxx 并且定位到 minepy-1.2.4\matlab 文件夹下

4. 在命令窗口运行代码    mex mine_mex.c ../libmine/mine.c   运行后得到 .mex64 文件

注:如果此步报错,可能是没有编译器 tdm-gcc,参考文章 https://blog.csdn.net/forever__1234/article/details/78148108        

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### 回答1: Maximal Information Coefficient(最大化信息系数)是一种用于计算变量之间相关性的方法。该方法可以在自然的、无监督的方式下学习变量之间的关系,而无需预设模型或参数。 MATLAB是一种用于科学计算和数据分析的工具。MATLAB提供了一系列内置的函数和工具箱来计算MIC(最大化信息系数)。要计算MIC,可以使用MATLAB中的mic函数。mic函数接受输入向量或矩阵作为参数,并返回两个变量之间的MIC值及其p值。 使用matlab进行MCI计算非常方便。只需从mic函数中提供需要计算的两个变量的数据,并选择任何其他可选参数(例如,MIC类型、置信水平等)。输出将包括MIC值及其p值。 综上所述,MATLAB提供了一个强大而灵活的工具,可以计算变量之间的最大信息系数。这是一种实用的方法,可用于许多领域,例如数据挖掘、模式识别、基因表达分析等。 ### 回答2: 最大互信息系数,即maximal information coefficient (MIC)是一种衡量两个变量之间关系的度量,它能够检测到线性和非线性的相关性。使用MATLAB可以方便地计算MIC值。 MATLAB中的MIC计算方法分为两步:第一步是利用单变量信息理论工具,计算两个变量中每一个变量和其它变量之间的互信息量,得到一个图像矩阵;第二步是根据wasserstein距离选择最大的单调关系,以便最终得到一个MIC值。 MATLABmic函数可用于计算MIC值。该函数需要输入两个变量的数组x和y,然后返回其MIC值。 使用MIC检测变量之间的关系有许多应用,比如在复杂数据集中发现变量之间的相关性以及在生物学中研究基因表达和疾病之间的关系等。由于其灵活性和易于操作性,MATLAB中的MIC计算工具在分析大量数据时具有重要的作用。 ### 回答3: 最大信息系数(Maximal Information CoefficientMIC)是一种用于量化两个变量之间关联度的方法,它能够识别出各种类型的关联关系包括非线性关系。Maximal Information Coefficient matlab是一个常用工具,用于计算最大信息系数,它可以帮助我们分析数据集,探测出它们之间的关联性。在matlab中安装了MIC工具箱后,我们可以使用mic函数来计算两个变量的最大信息系数,并以此评估它们之间的关联性。 使用mic函数进行最大信息系数分析时,需要输入两个变量的数值矩阵,返回的结果包括最大信息系数的值和P值。最大信息系数值越高,说明两个变量之间的关联程度越强。P值则表示其显著性程度,P值越小,说明结果越可靠。我们还可以通过设置变量之间的最小重合部分来完善结果。 最大信息系数是一种数据挖掘和机器学习方法,它可应用于许多领域,包括生物学,经济学和社会学等。在生物学中,最大信息系数可用于分析基因表达和生物多样性数据,探讨不同物种间的关联性。在经济学中,它可用于分析股票价格的波动和其他金融数据的关联,以便制定投资策略。最大信息系数的应用广泛,可帮助我们更好地理解变量间的关系,并从中提取有价值的信息。

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