RDKit | 基于分子指纹的分子相似性

最新推荐文章于 2023-05-22 22:03:55 发布
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分类专栏： RDKit | 化学信息学与AI 文章标签： RDKit  化学信息学 分子指纹 Python
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本文链接：https://blog.csdn.net/u012325865/article/details/102543725
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本文探讨了分子相似性原则，并介绍了利用RDKit库进行分子指纹评估的方法，包括MACCS Keys、拓扑指纹、Morgan指纹和Avalon指纹。重点讲述了Tanimoto系数在计算指纹相似性中的应用，并讨论了不同指纹之间的相关性。
摘要由CSDN通过智能技术生成

 

分子相似性：

相似性原理（similar property principle）指出，总体相似的分子应具有相似的生物活性。

相似性评估

化合物的指纹对于使用计算机考虑化合物的相似性是必需的。已经提出了各种评估方法，但是最常用的评估方法称为“ Tanimoto系数 ”。使用以下等式从两个分子A和B的位阵列指纹计算Tanimoto系数：

 

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