RDKit | 基于化合物结构式图像估算分子式(OpenCV、CNN)

简介

当通过深度学习输入有机物质中结构式的二维图像时，需要解决寻找分子式的问题。这是一个回归问题，需要计算结构式图像中包含的碳，氢，氧和氮等原子数。

基于化合物结构式图像估算分子式

环境

系统 ：Win10

工具：RDKit、OpenCV、Keras、TensorFlow

 

任务步骤

1. 训练数据300,000种化合物的SMILES字符串（足够的训练数据）。
2. 输入结构的二维图像可以提供足够的信息来理解分子结构。

使用RDKit将SMILES字符串转换为结构式图像，并进行了学习以计算图像中的原子数。

数据预处理

提取获得如下数据