【SimpleITK出现的image和mask世界坐标不一致的解决方法】

SimpleITK出现的image和mask世界坐标不一致的解决方法

以SimpleITK中image世界坐标是RAP而mask的世界坐标是RPI为例

正常mask应该对应image的世界坐标: 正常图像

异常mask对应image的世界坐标(很不幸镜面翻转了一样): 请添加图片描述

对x轴进行翻折和更换参考世界坐标系后:
请添加图片描述

简易的脚本转换 主要是对x轴进行翻折操作,然后再修改其Direction

import os
import numpy as np
import SimpleITK as sitk
import shutil
import pandas as pd

root_path = r"D:\Data\ZhongshanCT_result_recovername"
save_path = r"D:\Data\ZhongshanCT_modify"
xlsx_path = r"D:\Data\ZhongshanCT_modify\Modify_mask.csv"
RPI = (1.0, 0.0, 0.0, 0.0, -1.0, 0.0, 0.0, 0.0, 1.0)
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`SimpleITK.ReadImage()` 是 SimpleITK 库中的一个函数,用于读取图像数据。它可以从磁盘上的文件或内存中的数据读取图像,并返回一个 SimpleITK 图像对象。 下面是 `.ReadImage()` 函数的基本语法: ```python image = sitk.ReadImage(file_name, imageIO=None) ``` 参数说明: - `file_name`:要读取的图像文件的路径或 URL。可以是常见的图像格式,如 DICOM、NIfTI、JPEG 等。 - `imageIO`(可选):指定要使用的 ImageIO 对象来读取图像。如果未指定,则使用默认的 ImageIO。 `.ReadImage()` 函数返回一个 SimpleITK 图像对象,你可以使用它来访问图像数据和元数据,以及进行各种图像处理操作。 下面是一个示例,展示如何使用 `.ReadImage()` 函数读取图像文件: ```python import SimpleITK as sitk # 读取图像文件 image_path = "example.dcm" image = sitk.ReadImage(image_path) # 访问图像属性 size = image.GetSize() spacing = image.GetSpacing() origin = image.GetOrigin() # 显示图像信息 print("Image size:", size) print("Image spacing:", spacing) print("Image origin:", origin) ``` 在上面的示例中,我们首先导入了 SimpleITK 库,并使用 `.ReadImage()` 函数读取名为 "example.dcm" 的 DICOM 格式图像。然后,我们使用一些 SimpleITK 的函数来访问图像的属性,例如大小(size)、间距(spacing)和原点(origin)。最后,我们打印出这些图像信息。 需要注意的是,`.ReadImage()` 函数还可以读取内存中的图像数据。你可以将图像数据加载到内存中,并将其传递给 `.ReadImage()` 函数的 `file_name` 参数。 希望这个详细介绍能够帮助到你!如果还有其他问题,请随时提出。

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