生信踩坑
菠萝西斯
这个作者很懒,什么都没留下…
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搞定 conda 安装包报错问题
问题描述:conda install 报错$ conda install tophat2Collecting package metadata (current_repodata.json): doneSolving environment: failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve.Collecting package metadata (repodata.json): doneSolving environm原创 2021-05-11 09:15:29 · 2574 阅读 · 2 评论 -
shell 环境中的报错 syntax error:unexpected end of file
项目场景:在Windows下写好了脚本,拷到linux下运行出错。解决办法:用vi编辑器打开脚本,冒号后 ::set ff #在vim中查看文件的系统格式:set fileformat=unix #在vim中将系统文件格式改为unix原创 2021-05-08 15:55:28 · 147 阅读 · 0 评论 -
R语言 按照行名称取行
一句话概括,就是用行名代替下标。> TCGA_immunity B.cells.naive B.cells.memory Plasma.cells T.cells.CD8 T.cells.CD4.naive T.cells.CD4.memory.restingTCGA-F4-6461 0.338445536 0.00000000 0.0075827970 0.019359479 0 0.15701原创 2021-04-25 15:54:38 · 12514 阅读 · 4 评论 -
Conda 下 samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0 解决办法
samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared object file: No such file or directory:本质上就是samtools在执行的时候找不到lib里面的libcrypto.so.1.0.0原因分析:提示:首先看看自己小环境的lib:@hub$ ls /project/miniconda3/envs/hub/lib $ vi libcrypt原创 2021-04-20 10:52:36 · 2664 阅读 · 0 评论