WHU服务器下载SRA数据库方案

最新推荐文章于 2024-03-09 15:27:27 发布
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分类专栏： 学习笔记 文章标签： ubuntu
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提示：这里可以添加本文要记录的大概内容：
例如：随着人工智能的不断发展，机器学习这门技术也越来越重要，很多人都开启了学习机器学习，本文就介绍了机器学习的基础内容。

提示：以下是本篇文章正文内容，下面案例可供参考

一、你需要什么

177 地址下工作，一个明确的SRA。

二、你要怎么做

1. 准备下载索引

比如SRP266461（示例）：
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra?term=SRP266461

在这里插入图片描述
Send to —— File —— RunInfo
在这里插入图片描述
得到一个 SraRunInfo.csv, 其中就包含download.path

在这里插入图片描述
提出来，做一个TXT

$ cat list.txt 
download_path
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953231/SRR11953231.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953232/SRR11953232.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-20/SRR11953233/SRR11953233.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-21/SRR11953234/SRR11953234.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953235/SRR11953235.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953236/SRR11953236.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-20/SRR11953237/SRR11953237.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-21/SRR11953242/SRR11953242.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953243/SRR11953243.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-20/SRR11953244/SRR11953244.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-20/SRR11953245/SRR11953245.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953246/SRR11953246.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953247/SRR11953247.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-21/SRR11953248/SRR11953248.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953249/SRR11953249.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-20/SRR11953250/SRR11953250.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953251/SRR11953251.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-21/SRR11953252/SRR11953252.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953253/SRR11953253.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-21/SRR11953254/SRR11953254.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-20/SRR11953255/SRR11953255.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953256/SRR11953256.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953257/SRR11953257.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-21/SRR11953258/SRR11953258.1
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https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-
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三维卷积神经网络模型联合条件随机场优化的高光谱遥感影像分类
01-27
高光谱遥感影像分类通常基于地物光谱特征，但影像中同时还存在丰富的空间信息。空间信息的有效利用能显著提高图像分类效果。因其具有的特殊结构，卷积神经网络(CNN)已成功地应用在图像分类领域，对二维图像分类具有很好的效果。如何通过深度学习并结合空间光谱信息来提高分类性能是一个关键问题。结合高光谱影像中的空间特征与光谱信息，提出一种适合于高光谱像素级分类的深度学习三维卷积神经网络模型(3D-CNN)，并在初始分类的基础上利用多标签条件随机场进行优化。选取三个通用公开高光谱数据集(Indian Pines数据集、Pavia University数据集、Pavia Center数据集)进行测试，结果表明分类优化后精度得到很大提升，总体精度可达98%，Kappa系数达到97.2%。
公开数据集合：农作物、农业相关的数据集合
TSINGHUAJOKING
04-03 9689
01公开数据集合01公开数据集合提取码：woqh链接：提取码：7o03链接：提取码：lpa5。
【论文笔记】TINYCD: A (Not So) Deep Learning Model For Change Detection
m0_61899108的博客
11-17 2408
变化检测(CD)的目的是通过比较在不同时间拍摄的该地点的两幅图像来检测在同一区域发生的变化。CD具有挑战性的部分是跟踪用户想要突出显示的变化，例如新建筑，而忽略由于外部因素造成的变化，如环境、照明条件、雾或季节变化。深度学习领域的最新发展使研究人员在这一领域取得了突出的表现。特别是，不同的时空注意机制允许利用从模型中提取的空间特征，并通过利用两个可用的图像以时间方式将它们关联起来。缺点是这些模型变得越来越复杂和庞大，对于边缘应用来说往往是不可行的。
计算机视觉方向数据集汇总（更新中）
ydd的博客，记录生活
10-09 1467
建筑物提取数据集 1. Aerial Image Segmentation Dataset 文档分类数据集 2.Chinese Ethnic Ancient Handwritten Documents database, CEAHD2021-5 文档图像二值化数据集 3.德宏傣文古籍图像二值化数据集Tai Le historical document image binarization dataset, TLHDIBD2021 版面分析数据集 图像去噪数据集 姿态估计数据集 目标检测数据集 文字识别数据集
whu.rar_Help!_whu
09-19
`.cpp`是C++源代码文件，`.dsp`和`.dsw`是旧版本Visual Studio的工作区和解决方案文件，`.ncb`是Intellisense数据库，`.opt`存储了项目选项，`.plg`则记录了编译器的错误和警告信息。这暗示求助者可能使用的是C++...
SIRI-WHU Data Set
07-16
**SIRI-WHU遥感图像数据集详解** SIRI-WHU Data Set是一个专门针对遥感图像分类的大型数据集，由武汉大学测绘遥感信息工程国家重点实验室（WHU）与智能信息处理研究所（SIRI）联合发布。这个数据集包含12个不同的...
WHU-RS19 武汉大学深度学习数据集_whu building dataset 武汉大学,whu数据集
08-25
Transferring Deep Convolutional Neural Networks for the Scene Classification of High-Resolution Remo 所用数据源 WHU-RS Dataset. 从Google Earth（Google Inc.）收集的WHU-RS数据集[6]是一个新的公开可用的...
WHU-RS19 武汉大学深度学习数据集
12-11
WHU-RS Dataset. 从Google Earth（Google Inc.）收集的WHU-RS数据集[6]是一个新的公开可用的数据集，其包含大小为600×600像素的950幅图像，均匀分布在19个场景类中。一些示例图像如图5所示。我们可以看到，一些类别...
数据库课程设计实验三
06-14
实验名称 简单查询 – SELECT语句 实验目标 （1） 掌握order by，group by，having等子句的使用； （2） 掌握各种谓词的使用； （3） 掌握集合函数的使用； （4） 掌握在时间字段上的查询
WHU-RS19数据集
09-14
WHU-RS19是从谷歌卫星影像上获取19类遥感影像，可用于场景分类和检索。 相关工作： -G.-S. Xia, W. Yang, J. Delon, Y. Gousseau. H. Maitre, H. Sun, "Structural high-resolution satellite image indexing". Symposium: 100 Years ISPRS - Advancing Remote Sensing Science: Vienna, Austria, 2010
深度学习之遥感变化检测数据集整理
qq_41627642的博客
04-20 1万+
1、The River Data Set（高光谱河流变化检测数据） 该数据集包含两幅高光谱影像，分别于2013年5月3日和12月31日采集自中国江苏省的某河流地区，所用传感器为Earth Observing-1 (EO-1) Hyperion，光谱范围为0.4—2.5 μm，光谱分辨率为10 nm，空间分辨率为30 m，影像大小为463×241像素，共有242个光谱波段，去除噪声后有198个波段可用。影像中的主要变化类型是河道缩减。 图1 “River”数据集的高光谱影像 下载地址： 文件
数据集下载汇总
最新发布
caoyongsheng的博客
03-09 5915
国家数据是国家统计局发布统计信息的网站，包含了我国经济、民生、农业、工业、运输、旅游、教育、科技、卫生等多个方面的数据，并且在月度、季度、年度都有覆盖，较为全面和权威，对于社会科学的研究不要太有帮助。阿里巴巴datahub:https://github.com/alibaba/EasyNLP/tree/master/datahub。据 http://dataju.cn/Dataju/web/datasetInstanceDetail/325。2、魔塔社区的数据下载方式（中文数据社区）
好远好远的图像处理---综述
xys430381_1的专栏
08-31 2972
航空遥感图像(Aerial Images)目标检测数据集汇总 常规目标检测数据集有很多，现在前沿的目标检测算法（如Faster R-CNN, Yolo, SSD, Mask R-CNN等）基本都是在这些常规数据集上实验的，但是，基于常规数据集训练的分类器，在航空遥感图像上的检测效果并不好，主要原因是航空遥感图像有其特殊性： 1，尺度多样性，航空遥感图像从几百米到近万米的拍摄高度都有，且地面目标即使......
HUMAnN数据库国内备份下载源（转自刘永鑫博士github）
zlabx的博客
07-09 2040
百度云链接 R语言常用包合集 Windows 10版4.0.x：链接：https://pan.baidu.com/s/1JFwLP2SonK1howD5MNgNYg 提取码：l08k Windows 10版3.6.x：链接：https://pan.baidu.com/s/1h-qR2lmlaMgR4M7VbgtAFg 提取码：s5fi 下载后解压至当前目录，可获得3.6/4.0目录，剪切并替换文档 - R - win-library - 3.6/4.0 目录即可 扩增子数据库 宏基因组数据库 HUM.
点云数据集汇总整理（匠心之作，附官方下载地址）
热门推荐
qq_27816785的博客
05-19 4万+
点云公开数据集 1 点云分类和分割 1.1 ModelNet40 （点云分类） 普林斯顿 ModelNet 项目的目标是为计算机视觉、计算机图形学、机器人学和认知科学领域的研究人员提供全面、干净的对象 3D CAD 模型集合。 包含数据集： ModelNet40： ModelNet10： modelnet40_ply_hdf5_2048： modelnet40_normal_resampled 数据内容： 飞机、汽车、椅子、碗、瓶、键盘、楼梯、… 采集方式： 发布单位： 普林斯顿大学 下载地址： htt
【Python自动化运维】远程备份数据库并下载到本地
凡人运维传
02-14 1420
使用云服务的时候，将备份文件下载存放到本地来可以减少数据丢失的风险，实现数据容灾。 先看看下面用shell写的脚本 #!/usr/bin/bash # 文件命名，加上日期 file_name="mysql_backup`date +"%Y%m%d"`.sql" # 数据库备份命令 backup="mysqldump -uroot -proot --all-databases >
whu-river 数据集
09-09
whu-river数据集是一个用于河流水质监测和预测的数据集。该数据集由华中科技大学收集和创建，旨在帮助研究人员和决策者更好地理解和管理河流的水质问题。 该数据集包含了来自中国不同河流的水质监测数据，包括河水的化学指标、生物学指标、水文学指标和气象指标等。这些指标可以帮助评估河流的污染程度和水质状况，并提供对河流水质变化的预测。数据集中的每个样本都包含了特定时间点对应的水质指标数值。 使用whu-river数据集，研究人员可以进行水质分析、趋势预测和模型构建等工作。例如，可以通过分析数据集中的化学指标，了解河流中各种物质的含量和分布情况，进而评估河流的水质状况。同时，还可以利用数据集中的生物学指标，评估河流的生态系统健康度。 此外，whu-river数据集还可以用于建立水质预测模型。通过对历史数据的分析和挖掘，可以发现不同指标之间的关联性和规律，从而构建出准确预测水质的模型。这样的模型可以对未来水质状况进行预测，为决策者提供科学依据，制定更为有效的水资源管理和保护措施。 总之，whu-river数据集是一个宝贵的资源，对于研究河流水质和水资源管理具有重要意义。它提供了丰富的水质监测数据，可用于水质分析、趋势预测和模型构建等工作，为保护水环境和维护水质做出贡献。

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