七月论文审稿GPT第3.2版和第3.5版：通过paper-review数据集分别微调Mistral、gemma

v_JULY_v

已于 2024-06-29 17:42:35 修改

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分类专栏：七月科研论文大模型：含论文的审稿微调、阅读、写作、修订文章标签：论文审稿GPT paper-review数据集 Mistral 7B gemma 7B 大语言模型

于 2024-03-12 17:27:33 首次发布

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前言

我司审稿项目组一直在迭代论文审稿GPT(截止到24年3月底，审稿项目组成员除我之外，包括：阿荀、阿李、三太子、鸿飞、文弱等12人)，比如

七月论文审稿GPT第1版：通过3万多篇paper和10多万的review数据微调RWKV
七月论文审稿GPT第2版：用一万多条paper-review数据集微调LLaMA2 7B最终反超GPT4
七月论文审稿GPT第2.5和第3版：分别微调GPT3.5、Llama2 13B以扩大对GPT4的优势

所以每个星期都在关注各大公司和科研机构推出的最新技术、最新模型

而Google作为曾经的AI老大，我司自然紧密关注，所以当Google总算开源了一个gemma 7b，作为有技术追求、技术信仰的我司，那必须得支持一下，比如用我司的paper-review数据集微调试下，彰显一下gemma的价值与威力

此外，去年Mistral instruct 0.1因为各种原因导致没跑成功时(详见此文的4.2.2节直接通过llama factory微调Mistral-instruct)，我总感觉Mistral应该没那么拉胯，总感觉得多实验几次，所以打算再次尝试下Mistral instruct 0.2「当然，本文只展示部分细节，更多细节则见七月的《大模型商用项目审稿GPT微调实战》」

最后值得一提的是，我司审稿项目组还在通过80G的A100微调mixtral 8×7b中了，历经9个月，连续迭代7个版本，只为把审稿效果不断做到极致(超越GPT4在第2个版本就做到了)，最终以「无限接近人工reviewer的效果」辅助审稿者审稿、辅助作者修订论文，但如下图所示，过程中也走了不少弯路

第一部分论文审稿GPT第3.2版：微调Mistral 7B instruct 0.2

1.1 23年12月版的Mistral-7b-Instruct-v0.2：上下文长度8K

关于Mistral 7B的介绍，请看此文《从Mistral 7B到MoE模型Mixtral 8x7B的全面解析：从原理分析到代码解读》的1.1节Mistral 7B：通过分组查询注意力 + 滑动窗口注意力超越13B模型

1.1.1 Mistral 7B-Instruct：微调时其长度扩展的能力从何而来

由于Mistral 7B-Instruct(特指在24年3.24之前的版本)和Mistral 7B一样，其长下文长度都只有8192

而论文审稿GPT这个项目对模型上下文的长度要求12K以上，故需要扩展Mistral 7B-Instruct的上下文长度，如何扩展呢

考虑到如此文《七月论文审稿GPT第2版：用一万多条paper-review数据集微调LLaMA2 7B最终反超GPT4》4.1节所介绍的

Yarn-Mistral-7b-64k自己实现了modeling，即把mistral的sliding windows attention改了，相当于把sliding windows的范围从滑窗大小直接调到了65536即64K(即直接滑65536那么个范围的滑窗，其实就是全局)
那类似的，给Mistral 7B–Instruct加YaRN行不行？
然问题是不好实现：YaRN-Mistral 7B – Instruct，因为Yarn是全量训的方案，而大滑窗范围+全量很吃资源
受LongLora LLaMA的启发，既然没法给Mistral 7B–Instruct加YaRN，那可以给其加longlora么？
然问题是mistral又没法享有longlora，因为mistral的sliding windows attention和longlora的shift short attention无法同时兼容，但要对原chat模型的上下文长度进行有效扩展又会需要shift short attention

不得已，故再考察下它所用的RoPE(相关代码见：transformers/src/transformers/models/mistral/modeling_mistral.py)，毕竟RoPE可以使得模型的上下文长度直接外推10-20%

然，在我们后续实际微调23年12月份版本的Mistral 7B-Instruct 0.2时(其上下文长度还只有8K)，实际支持其获得更长上下文能力的还是归结于其滑动窗口注意力(sliding window attention，简称SWA)，毕竟SWA可以有效处理任意长度的序列

怎么发现的呢？如下图所示的“大海捞针”实验，纵轴是对应语句放在文章中的位置(从头到尾)，如果是外推的话不会有图中那个斜杠(因为外推的话无论输入多长的序列，它的ppl都是稳定的，即右上角应该是绿色才对)，故从图中可以很明显的看出来Mistral的window size就是4k(每次只计算4k范围内的注意力)
总之，对于Mistral或gemma如果通过rope去外推，算是没有办法的办法，但Mistral有滑动窗口注意力的话，反正无论输入长度多长，它每一个token只计算在它之前(含它自己)的4096个token的注意力，相当灵活，故自然也就轮不到用rope去外推了

1.1.2 7b-Instruct-v0.2基于「新上线的Mistral-7B-v0.2」把上下文长度升级到32K

24年3.24日，我司审稿项目组的文弱发现，Mistral AI悄悄发布了Mistral-7B-v0.2(我们最早是在mistralai/Mistral-7B-Instruct-v0.2在hg上的页面上确认到的，其次是redit上有用户说Mistral-7B-v0.2已上传至HF )

Mistral-7B-v0.2 has the following changes compared to Mistral-7B-v0.1

然后他们又把三个月之前发布的Mistral-7b-instruct-0.2基于最新的Mistral-7b-v0.2升级了下(但他们当天只是更新一下readme，32K的instruct-0.2在当天还没有正式放出来啊 )

相当于

Mistral于23年9月就发了7b第一个版本，和Mistral-7b-instruct-0.1(当时，他们用滑动窗口注意力把7b-0.1扩展到的8K上下文)
再后来(即大概23年12月)，他们推出了Mistral-7b-instruct-0.2
然后现在(大约24年3.24日早上8点)，推出了Mistral-7b-0.2版本(7b-0.2版本没用滑动窗口注意力了，毕竟现在上下文扩展没半年前那么困难了，所以不需要再依赖滑窗便可让7b-0.2直接干到32K，当然还没看到怎么直接干到32K的 )

同时把之前的Mistral-7b-instruct-0.2 基于Mistral-7b-0.2 升级了下，升级之后还是叫Mistral-7b-instruct-0.2，但上下文窗口从升级之前的8K到了现在的32K了

但遗憾的是，截止到3.25，Mistral AI还未对外上传32K的instruct-0.2

1.2 基于llama factory + 5K/15K数据微调Mistral-7b-Instruct-v0.2(23年12月份的版本) by鸿飞

把训练数据，格式是：{"input":"论文内容", "output": "review data"}}的数据，按照LLama-Factory目录下面的dataset_info_zh.md中的步骤，把数据整理成为羊驼alpaca的格式

一开始--per_device_train_batch_size 1设置为1，启动程序，还会发生内存不足的问题
经过检查以后，发现是论文长度比较长，又把论文和review数据截断为12288的数据长度，再放到data目录下面，per_device_train_batch_size设置为3，正常运行，但是内存已经到了47G了，但是早上发现在运行到了晚上4点，程序因为内存不足而退出了
断点续跑：
重新启动程序，设置--resume_from_checkpoint checkpoint-660，修改运行的batch_size为2，重新把程序从上次退出的地方跑起来。发现内存占用为33G/48G。剩余时间大约12个小时跑完

以下是训练过程中的其他细节

模型超时解决：--ddp_timeout 180000000
长度外推方式
目前只支持Linear和dynamic NTK
为了加快训练速度，使用deepspeed s2 + 4bit+NF 量化
使用了flash-attn：不过训练速度没有明显地提升
租的机器的cuda版本是11.8，安装了最新的torch，发现和cuda不匹配，更新cuda的话太麻烦，所以按照llama factory开发者的建议：
pip uninstall torch torchvision torchaudio
pip install torch torchvision torchaudio --index-url https://download.pytorch.org/whl/cu118

LLamaFactory推荐deepspeed==0.13.5
但运行以后，json.dumps表示不能保存这种数据，怎么办？

    {
        'loss': 1.9611, 
        'grad_norm': tensor(4.6666), 
        'learning_rate': 2.5e-05, 
        'epoch': 0.0
    }，

最后通过安装 deepspeed==0.13.1 解决

如鸿飞如说

运行程序的时候，尽量留够一定的内存空间，否则会出现中途退出的问题
对于一些特定的错误，不会解决的时候，最好找LLama-Factory的开发者去解决，否则自己很难定位出错误的位置。trick: LLama-Factory上面的多加几个群，这样子可以多学习官方人员的解决思路
机器cuda与python的版本号最好是一致的。
量化后的模型与主模型不能合并。量化模型不能合并

最后推理时，务必注意把推理时的数据组织格式改成「Mistral推理时所要求的格式」

即用Mistral提供的API，进行组织数据格式
总之，如鸿飞所说，在预测的时候，我自己不瞎组织测试数据。严格按照mistral要求的数据格式进行输入，然后输出就没有问题了

更多见七月的《大模型商用项目审稿GPT微调实战》

1.3 对「Mistral-7b-Instruct-v0.2(23年12月版)之paper-review微调版」的评估

下图是通过5K数据微调Mistral 7B instruct的评估结果

更多见七月的《大模型商用项目之审稿GPT微调实战》

第二部分论文审稿GPT第3.5版：微调Google gemma

提前说下，Google gemma的介绍，请见此文《一文速览Google的Gemma：从gemma1到gemma2(2代27B的能力接近llama3 70B)》的第一部分

2.1 基于TRL通过15K数据对gemma-7b-it进行微调与模型评估 by阿李

2.1.1 通过A40微调时设置为模型的默认长度8K

由于gemma所用的rope可以从8096外推到增长10-20%，即吃我们12K以上长度的paper-review数据条，不是啥问题

不过，我们在训练时用的48G的A40，如果把模型长度设置为12K 则会爆显存(9 10 11 12中，9k能跑，其他都显存爆掉)，最终不得已，还是把模型的长度设置为默认长度8K，最终基于1台A40耗费了差不多1周的时间

2.1.2 通过TRL包对gemma-7b-it进行微调的关键结论/细节与环境配置

以下是一些关键结论

使用TRL的SFT Trainer对gemma-7b-it进行微调(关于TRL包的介绍请看此文的第一部分)
其中模型的max_seq_length设置为1024*8，也就是没有外推，直接使用默认8K。
在train阶段没有对paper+review的组合进行截断，在inference则对paper做截断(即只保留paper的前1024*7长度)

以下是一些关键的微调细节

微调参考gemma官方在huggingface公布的微调样例代码：https://huggingface.co/google/gemma-7b/blob/main/examples/example_sft_qlora.py
本质是用trl的SFT Trainer和transformers的模型加载，写一个微调脚本
主要修改点是dataset的适配以及超参数
主要难点是解决python包的冲突(官网案例只有代码没有环境)，以及预测时候的维度不一致的问题解决
另外网上还有一种方案：clone trl的github的框架代码，然后在这个项目框架里面写微调样例，这个方案在环境配置的时候总有包版本冲突，故该方案暂时搁置

以下是本次微调所涉及到的环境配置

conda create -n gemma python=3.9 pip
source activate
conda activate gemma
pip install torch==1.13.0+cu117 torchvision==0.14.0+cu117 torchaudio==0.13.0 --extra-index-url https://download.pytorch.org/whl/cu117
pip install accelerate==0.27.2 trl==0.7.11 transformers==4.38.2 datasets==2.16.0 peft==0.9.0

2.1.3 微调代码修改

超参数

per_device_train_batch_size=1
per_device_eval_batch_size=1
gradient_accumulation_steps=16
learning_rate=2e-4
max_grad_norm=0.3
weight_decay=0.001
lora_alpha=16
lora_dropout=0.1
lora_r=64
max_seq_length=1024*8
dataset_name="./data/paper_review/paper_review_data_longqlora_15565.jsonl"
fp16=False
bf16=True
packing=False
gradient_checkpointing=True
use_flash_attention_2=True
optim="paged_adamw_32bit"
lr_scheduler_type="constant"
warmup_ratio=0.03
save_steps=10
save_total_limit=3
logging_steps=10
num_train_epochs=2

模型加载和量化以及lora配置，代码见七月的《大模型商用项目审稿GPT微调实战》

数据集加载格式定义以及prompt设置

def formatting_func(example):
    # text = f"### USER: {example['data'][0]}\n### ASSISTANT: {example['data'][1]}"
    text = """
    Below is an instruction that describes a task, paired with an input that provides further context. Write a response that appropriately completes the request.
    ### Instruction:
    You are a professional machine learning conference reviewer who reviews a given paper and considers 4 criteria: ** importance and novelty **, ** potential reasons for acceptance **, ** potential reasons for rejection **, and ** suggestions for improvement **. The given paper is as follows.
    ### Input:
    {paper}
    ### Response:
    {review}
    """.format(example[0],example[1])
    return text

微调和保存，代码见七月的《大模型商用项目之审稿GPT微调实战》

2.1.4 gemma评估结果：审稿效果超越GPT4不少，是目前sota

预测时，如果遇到同一个文章的多次结果都预测一样，则记得：do_sample=True

最终的评估结果告诉我们，大家不要小看Google的gemma，在同样的论文审稿场景下、同样的数据集下，微调后在目前的几个模型中取得了目前最好的效果(当然，24年4月初先后被mixtral 8x7b超过了)
比如略微超过之前微调llama2的结果(在GPT4-1106做裁判的情况下，之前微调过后的llama2 7B对GPT4-1106的胜率仅为63.16%，微调过后的llama2 13B对GPT4-1106胜率仅为75.44%)

所以，当微调后审稿效果超过GPT4-1106(裁判也使用的gpt-4-1106-preview)，则很自然了

2.2 基于llama factory通过5K/15K数据微调gemma-7b-it by文弱

2.2.1 微调gemma-7b-it的详细过程

下载模型
需要先在hugging face 页面生成access token：
然后先在服务器上下载lfs
```
# 安装git-lfs
curl -s https://packagecloud.io/install/repositories/github/git-lfs/script.deb.sh | sudo bash
sudo apt-get install git-lfs

# 激活git-lfs
git lfs install
```
如果服务器是auto-dl上的话，建议开启科学加速：
```
source /etc/network_turbo
```
开始下载：
```
git lfs clone https://huggingface.co/google/gemma-7b-it
```
下载过程中，需要输入username和password，username就是hugging face上的用户名，密码为最开始生成的access token，粘贴复制就可以了

下载llama-factory的repo：

git clone https://github.com/hiyouga/LLaMA-Factory.git

配置环境：

conda create -n llama_factory python=3.10

3.1) 需要conda init bash 然后重启对话

conda activate llama_factory
cd LLaMA-Factory

3.2) 然后先下载这几个包：

pip install torch torchvision torchaudio --index-url https://download.pytorch.org/whl/cu118

安装flash_attn之前要先pip install packaging，然后再flash-attn==2.5.5
然后需要这种方式安装bitsandbytes:pip install bitsandbytes==0.41.3 --default-timeout=100

将requirements.txt中的包修改为适配本机cuda版本以及llama-factory推荐版本：

transformers==4.38.2
datasets==2.17.1
accelerate==0.27.2
peft==0.9.0
trl==0.7.11
gradio>=3.38.0,<4.0.0
scipy
einops
sentencepiece
protobuf
uvicorn
pydantic
fastapi
sse-starlette
matplotlib
deepspeed==0.13.1

修改之后再下载

pip install -r requirements.txt

修改数据集为适配llama-factory的alpaca模式：
首先把instruction存入一个json文件中(文弱这边命名为extra.json)：

{"instruction":"You are a professional machine learning conference reviewer who reviews a given paper and considers 4 criteria: ** importance and novelty **, ** potential reasons for acceptance **, ** potential reasons for rejection **, and ** suggestions for improvement **. The given paper is as follows.\n"}

然后再写一个脚本将该json文件插入到待测评文件的每一行「每一行均为一个json对象，至于测评文件见七月的《大模型商用项目之审稿GPT微调实战》」中，脚本写做：

while IFS= read -r line; do
    echo $line | jq -c --slurpfile extra extra.json '. + $extra[0]' >> addtest.jsonl
done < paper_review_test.jsonl

运行该脚本得到了符合llama-factory格式的数据集，并将生成的数据集拷贝到repo的data文件夹中，并修改data文件夹中的dataset_info.json，添入以下段落：

  "addtest": {
    "file_name": "addtest.jsonl",
    "columns": {
      "prompt": "instruction",
      "query": "input",
      "response": "output"
    }
  }

微调步骤：
5.1) 先将train_web.py修改为：
```
from llmtuner import create_ui

def main():
    demo = create_ui()
    demo.queue()
    demo.launch(server_name="0.0.0.0", server_port=6006,share=False, inbrowser=True)

if __name__ == "__main__":
    main()
```
5.2) 然后运行该python程序：
```
nohup python train_web.py > web.log 2>&1 &
```
5.3) 打开实例中的自定义服务：
5.4) 然后在webui中，选择好微调好的参数并复制预览命令，并写入脚本「详见七月的《大模型商用项目之审稿GPT微调实战》」
5.5) 运行脚本文件：
```
nohup ./sft.sh> sft.log 2>&1 &
```
合并模型权重
「详见七月的《大模型商用项目之审稿GPT微调实战》」
利用合并后的模型进行推理：
刚开始在webui界面生成发现老报错，最初以为是截断长度仍然过长，但是将截断长度设为100的时候仍然报错，后来用了命令行来debug，在log中发现了进行推理需要再安装几个包
首先安装好这几个包：
```
pip install jieba
pip install nltk
pip install rouge_chinese
```
启动推理：
提取模型推理输出：
「以上没有介绍的相关细节，详见七月的《大模型商用项目之审稿GPT微调实战》」

可能会用到的其他工具：

pip install jupyterlab
apt install jq
apt install dos2unix

2.2.2 对gemma-7b-it微调之后的效果评估

一开始文弱通过5K数据基于llama factory微调gemma-7b-it，后来又通过15K数据再微调一遍

一张48g的a40，至于微调时长，5k是35个小时，15k是110小时
都是默认温度0.35的话，5k比15k好，但是15k提高温度到0.5就好于5k了(不管5k温度是0.35还是0.5)

下图左侧的温度是0.35，下图右侧的温度是0.5

更多细节，详见七月的《大模型商用项目之审稿GPT微调实战》