PYG教程【三】对Cora数据集进行半监督节点分类

Cora数据集

PyG包含有大量的基准数据集。初始化数据集非常简单,数据集初始化会自动下载原始数据文件,并且会将它们处理成Data格式。

如下图所示,Cora数据集中只有一个图,该图包含2708个节点,10556条边,节点类别数为7,特征维度为1433。并且默认已经对数据集进行了划分,分为了训练集、验证集和测试集。

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然后看看节点特征和标签。x为节点特征矩阵,维度为2708*1433。y为节点标签向量,维度为2708,类别为7。
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用GCN进行半监督节点分类

接下来就可以构建一个简单的GCN模型,在Cora数据集上进行半监督节点分类。

下面的GCN模型包含两个图卷积层。第一层输入维度为1433(节点特征维度),输出为16(与第一层输出一致),后面接上一个relu激活函数,以及dropout操作。第二层输入维度为16,输出为7(节点标签数量),后接log_softmax函数进行分类。

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模型构建完成后,指定训练设备为GPU(没有的话就用CPU),注意这里默认使用的是0号cuda。如果cuda:0被占用了的话会报错,需要指定其他号码的cuda才能运行。然后,分别将GCN模型以及Cora图数据送入指定的设备。

优化器选择Adam,学习率设置为0.01,权重衰减设置为5e-4。这些都配置好以后就可以训练模型了,epoch设为200,每个epoch后清除上次的梯度信息,然后用nll_loss计算出训练集上的损失,调用backward函数计算出梯度后传回给Adam优化器进行参数更新。
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最后在测试集上评估模型,计算分类正确率accuracy并显示。

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至此,就完成了Cora数据集上的节点分类任务了。

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在使用PyTorch Geometric (pyg)创建自制数据集时,你可以继承`InMemoryDataset`类,并重写一些必要的方法来实现数据集的下载、处理和加载。首先,你需要定义一个类,例如`MyDataset`,并将其继承自`InMemoryDataset`。在构造函数中,你可以调用父类的构造函数,并在其中加载数据集。你可以使用`torch.load`函数加载数据,并将其赋值给`self.data`和`self.slices`。同时,你可以重写`raw_file_names`和`processed_file_names`方法来指定原始文件和处理后的文件的名称。在`download`方法中,你可以实现数据集的下载逻辑。在`process`方法中,你可以对数据集进行处理,并将处理后的数据保存到指定的路径。最后,在`collate`函数中,你可以将一个python列表形式的数据转换为`InMemoryDataset`内部存储数据的格式。你可以使用`data_list\[0\].__class__()`来创建一个空的数据对象,然后将列表中的每个数据对象转换为该类型。\[2\]\[3\] #### 引用[.reference_title] - *1* [在PyG上构建自己的数据集](https://blog.csdn.net/qq_32113189/article/details/126663738)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^koosearch_v1,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item] - *2* *3* [【PyG入门学习】四:构建自己的数据集](https://blog.csdn.net/TwT520Ly/article/details/105633847)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^koosearch_v1,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item] [ .reference_list ]

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