Centos6.6 yum源更新方法及R软件安装,R模块安装

新到的集群(centos 6.6)

准备安装些常用软件

yum install softwarename

安装第一个软件yum install R

发现找不到源路径,解决办法,更新yum源(来源https://blog.csdn.net/owangf_dl/article/details/78966369)

1、备份

cp /etc/yum.repos.d/CentOS-Base.repo /etc/yum.repos.d//CentOS-Base.repo.ori

2、下载新的CentOS-Base.repo 到/etc/yum.repos.d/

wget -O /etc/yum.repos.d/CentOS-Base.repo http://mirrors.aliyun.com/repo/Centos-6.repo

3、清理

 yum clean all

4、更新缓存

yum makecache
yum install tree -y
yum update -y

https://cran.r-project.org/ 下有linux下R安装说明:

sudo yum install R

安装完后显示complete,运行R,OK

R version 3.4.3 (2017-11-30) -- "Kite-Eating Tree"
Copyright (C) 2017 The R Foundation for Statistical Computing

Platform: x86_64-redhat-linux-gnu (64-bit)

安装完后突然发现没有指定目录,不知道安装在到哪个目录下,查了下方法:

rpm -qal |grep "/R/" |less

发现,R目录在/usr/share/R /usr/include/R /usr/lib64/R 下面,安装目录主目录在/usr/lib64/R下,普通用户测试了下,R可用,/usr/lib64在默认的环境变量里。

使用普通用户来安装R包。

R进入R运行窗口, install.package("ggplot2"), 目录无权写入,新建私有目录,安装即可,选择中国镜像

root账号直接安装即可,安装时间比较长,因为新安装的R软件,里面包少,安装ggplot2时安装的依赖包非常多。还好是在线,哈哈,要离线得一个一个依赖包去安装。

同时用root账号与普通账号安装的ggplot2包,root账号先完成,同样的网络,可能是普通账号前期有些文件要下载,root不用。

安装完后

library("ggplot2")

没报错即安装成功。

测试可用,安装的模块目录 /usr/lib64/R/library/ ,发现好多包了,很多是ggplot2的依赖包

assertthat  cli         compiler   digest   graphics   KernSmooth  magrittr  mgcv     parallel  RColorBrewer  rpart    stats    survival  translations
base        cluster     crayon     foreign  grDevices  labeling    MASS      munsell  pillar    Rcpp          scales   stats4   tcltk     utf8
boot        codetools   datasets   ggplot2  grid       lattice     Matrix    nlme     plyr      reshape2      spatial  stringi  tibble    utils

class       colorspace  dichromat  glue     gtable     lazyeval    methods   nnet     R6        rlang         splines  stringr  tools     viridisLite

安装完R及包后开始画图,保存图片为tiff格式时报错

No TIFF support in this version of R

暂时未解决



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安装本地yum源

2014年08月23日 1KB 下载

R语言安装程序(windows版)

2012年03月13日 46.63MB 下载

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