最全整理:R/Rstudio/R包的更新

R 是开源的数据分析和统计计算语言,功能强大且应用广泛,R 的版本更新频率较高。最近处理数据时突然有一个 R 包无法安装,细探究发现这个 R 包需要新版本 R 的才可以安装。本文主要分享:更新 R、更新 Rstudio 和一键升级 R 包。

更新 R 和 Rstudio

1.输入命令更新 R

在 Rstudio/R 中更新 R,输入以下命令:

install.packages('installr')
library(installr)
updateR()

在 R 中运行时:

1.首先打开 R,选择镜像(China 随便选一个就可)
805490bf509590483b895ab3b30c0cfb.png
2.运行三行代码

会显示如下界面,如果已经有了新版本,点击确定

b2bc5452c348989801153fc911af1c43.png 不看新闻点击 cd570f011753afa91878bc12172b3521.png 再次确认是否安装最新版本的 R,点击 确定 5c3aacf9794df6f6ec13ba6c172ff26c.png

接下来就开始安装了

98036bff06211e9392ec10bdaf8893fc.png

安装成功即可。

2.官网下载最新版本 R

https://www.r-project.org/

fe4a2f507c22ec7f1afa3cf6dfbe03fd.png 25d4e27e98837f2f4ee821b88c15e5f1.png

最新版本在最下面,一般下载.gz 的压缩包,下载完安装即可。

3.更新 Rstudio

进入 Rstudio 官网:https://posit.co/downloads/ 点击 DOWNLOAD RSTUDIO ---> DOWNLOAD RSTUDIO DESKTOP FOR WINDOWS

74a44ce87ebdf3ff131ed274a87cba95.png 70e41518bf804fd011f6447ccd4af5aa.png

4.更换 Rstudio 的 R 版本

Tools--->Global Options

3c412046d35e8c5ed898de31d1abbc60.png

点击 change 更换 R 版本

03c4a5c59dfd18ddc42307b196b2d568.png

换完版本不要忘了点击两个 OK, 然后再重启一便RStudio即可,这样就是完全更新完了

95d1362f1aaeb03f77ced0d20da4d192.png

升级 R 包

1.输入命令更新 R 包

跑代码的时候可能会遇到 R 包版本不匹配或者附加包不匹配的情况,所以需要更新完 R 版本的同时需要升级我们的 R 包
输入命令直接升级所有 R 包(CRAN、Bioconductor、GitHub)

## 安装rvcheck包
install.packages("rvcheck")
## 加载rvcheck包
library("rvcheck")
#检查R是否有更新
rvcheck::check_r()

rvcheck::update_all(check_R = FALSE,
                    which =c("CRAN","BioC","github"))

2.复制粘贴 R 包

首先找到旧版本 R 包安装的路径,在命令行中输入.libPaths() 就可以找到 R 包的位置,此处输出的第一个路径为 R 包安装的位置

.libPaths()
[1] "C:/Users/B/AppData/Local/R/win-library/4.4" "C:/Program Files/R/R-4.4.1/library"

打开路径可以发现有两个或三个文件夹,把 4.3 文件内的文件复制粘贴到 4.4 即可

90edff6b7109b459a66cd5d9ae338cec.png

平常更新完 R 版本总是懒得重新安装 R 包,所以就会把自己之前安装的 R 包全部打包压缩好,这样就可以方便自己安装了。

到这里 R、Rstudio 和 R 包就都更新完了,本期的分享到此结束,希望对大家有所帮助!本人也是处于学习阶段,如有问题可以评论区留言哦!

推荐阅读

一键分析10X单细胞数据点击图片跳转

f17a6fad41730516022fd3cc9b2e2a4e.jpeg

一键分析Bulk转录组数据点击图片跳转

c7202abc0cf0a1f5c05d37baa5134784.jpeg

简说基因 | 精选文章合辑点击图片跳转0c9bf21a39d0c24a329091afa23b6498.jpeg


生信平台

Galaxy生信云平台(UseGalaxy.cn)致力于降低生信分析门槛,让无专业背景的用户也能轻松分析数据。

  • • 界面化操作与强大的计算资源。

  • • 成百上千工具和流程免费使用。

  • • 丰富的可视化和交互分析工具。

  • • 强大的数据共享以及协作能力。

联系方式

d3b7fa790fcb041ffcf2759ef291b0ad.png

RStudio是一款功能强大的集成开发环境,常用于R语言开发和数据分析。在使用RStudio进行数据分析时,经常需要使用各种R来扩展其功能。为了保持RStudio的稳定性和充分利用新的功能和bug修复,我们需要经常更新RStudio中的更新RStudio中的有以下几个步骤: 1. 打开RStudio,在RStudio控制台中输入或点击菜单栏的 "Install",在弹出的对话框中选择要更新。可以选择更新一个或多个。 2. 确认选择后,RStudio会自动从CRAN(Comprehensive R Archive Network)上下载并更新选中的。这需要连接到互联网。 3. 下载完成后,RStudio将自动安装新版本的。可以在RStudio控制台中查看安装进度。 4. 更新完成后,可以使用新的版本进行数据分析和编程。 更新RStudio中的有几个重要的原因: 1. 修复bug:R更新可能含对之前版本中存在的bug的修复。通过及时更新,可以确保自己的分析结果的准确性。 2. 新功能增加:R更新通常会引入新的功能和函数,可以帮助我们更好地处理数据。及时更新可以充分利用这些新功能,提高数据分析的效率和准确性。 3. 安全性问题:R更新还可以修复之前版本中的安全漏洞。保持的最新版本将有助于确保我们的数据分析过程和结果的安全。 在更新RStudio中的时,我们应该注意以下几点: 1. 确保有可靠的网络连接,因为更新需要从互联网上下载。 2. 更新之前,最好备份当前的数据和代码,以防安装新的导致之前的代码无法正常运行。 3. 如果某个是特定项目或研究中的关键依赖,更新前最好阅读更新日志,以确保新版本没有引入不兼容的更改。 总之,定期更新RStudio中的可以帮助我们保持软件的稳定性和安全性,同时充分利用新的功能和bug修复。
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值