ITK SimpleITK Window环境下编译

爬行程序猿

已于 2024-04-10 09:54:50 修改

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分类专栏： ITK 文章标签：计算机视觉人工智能

于 2024-04-09 18:09:48 首次发布

本文链接：https://blog.csdn.net/wang6562009/article/details/137561430

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本文分享了作者在Windows环境下使用ITK进行3D数据分割时，从Python版转到C++及CUDA版本的编译过程，包括遇到的问题如CMake设置和错误修复，以及对SimpleITK的使用体验和建议。

摘要由CSDN通过智能技术生成

前言

最近在工作中涉及到3D 数据的分割，深度学习方法慢，且构建数据集费时费力，经过一番查找，最终选择使用ITK这个库。最开始的时候是使用python 环境下的SimpleITK ,也实现了我想要的功能。但最终要和QT C++ 的项目合并，所以只能使用C++ 下的代码了。后来因为速度上的问题，又编译了基于Cuda 11.2 的GPU 版本的ITK.

这里记录一下我在使用ITK 过程中遇到的坑和问题，希望能给后来人有些帮助。

环境

windows10
ITK-5.3.0
VS 2019
Cuda 11.2
CMake 3.17.0-rc2

编译

安装VS2019 cmake,这个不多说了，然后下载ITK ，最开始的时候还编译过5.1这个版本，后来发下5.3 应该是有有些优化，速度上会更快，因此用了5.3。下载地址：https://github.com/InsightSoftwareConsortium/ITK/releases/download/v5.3.0/InsightToolkit-5.3.0.zip

然后用CMake 打开源码路径，并创建build路径，在cmake中选择。这里遇到我编译时的第一个坑。因为编译输出后是要调用的，所以需要输出dll,也就是需要buidl shared lib，我对cmake 也不是很熟悉,上了一看，是没有shared lib,以为是版本不行，又换了好几次版本。

经过摸索发现，需要点击这里就会出现shared lib 了，还是不熟悉导致的。差点因为这个花钱买别人的专栏看。

然后Configure 下

应该是没有啥问题，如果是有缺少文件，或者下载文件失败的问题就去下载相应的文件到对应的目录中。

如果要是编译GPU 版的话还需要选择GPU

编译完成后，打开项目，点击ALL_BUILD -> 生成，之后INSTALL ->生成，如果没改生成路径的话，最终会安装到 C:\Program Files (x86)\ITK 下

如果是调试阶段，可以在Debug 模式下编译，如果投入使用，建议还是Release，速度真的不是快的一点半点啊（血的教训 =；=）。

测试

编译完成后就可以使用ITK了，因为不清楚哪些lib库和dll 库不需要，所有就把所有的库都加上了。

在VS2019 中引入头文件，和所有的lib库（这里库太多，一个个添加太麻烦，使用了这个命令

dir /b *.lib > out.txt, 将所有lib 库的名输出到txt 中，然后复制过去）。

测试代码（来自官方文档）：

#include "itkImage.h"

int main(int, char *[])
{
  // 生成一个三维的数据，数据类型是 无符号16位整型
  using ImageType = itk::Image<unsigned short, 3>;
  auto image = ImageType::New();
  ImageType::IndexType start;
 
  start[0] = 0; // first index on X
  start[1] = 0; // first index on Y
  start[2] = 0; // first index on Z
  ImageType::SizeType size;
  size[0] = 200; // size along X
  size[1] = 200; // size along Y
  size[2] = 200; // size along Z
  ImageType::RegionType region;
  region.SetSize(size);
  region.SetIndex(start);
  image->SetRegions(region);
  image->Allocate();

  return EXIT_SUCCESS;
}

然后可能会遇到这样的问题：

“itk::ShapedNeighborhoodIterator<TImage,TBoundaryCondition>::ConstIterator”: 是非法基类“

itk::LabelMap<TLabelObject>::GetNthLabelObject”: 无法将函数定义与现有的声明匹配

我的做法是