jupyter notebook服务器环境搭建及内核管理

jupyter远程访问服务搭建及内核管理

环境准备

sudo apt-get install update
sudo apt-get install python3 python-pip
sudo pip3 install jupyter

修改pip源

Linux编辑 ~/.pip/pip.conf ，在最上方加入如下内容：

[global]
index-url = https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple
[install]
trusted-host = https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn

虚拟环境（可选）

sudo pip install -U virtualenv
virtualenv venv -p python3
source venv/bin/activate

创建登陆密码

from notebook.auth import passwd
print(passwd("jupyter"))

Out[2]: ‘sha1:*******************’

创建ssl证书（https连接需要，http可跳过）

openssl req -x509 -nodes -days 365 -newkey rsa:1024 -keyout mycert.pem -out mycert.pem

编辑配置文件

jupyter notebook --generate-config

root用户加上–allow-root

在当前用户根目录下生成..jupyter/jupyter_notebook_config.py文件
修改以下内容：

c.NotebookApp.allow_remote_access = True  # jupyter 4.5版本以上需要配
c.NotebookApp.allow_root = True     #允许root用户运行
c.NotebookApp.ip = '*'   # 允许远程访问（备用参数0.0.0.0）
c.NotebookApp.notebook_dir = r'/root/jupyter'  # 启动目录
c.NotebookApp.open_browser = False    # 默认不启动浏览器
c.NotebookApp.password = 'sha1:xxxxxxxxxx' # 上面生成的密钥
c.NotebookApp.certfile = u'c:/jpyb/mycert.pem'  # 指定文件路径
c.NotebookApp.keyfile = u'c:/jpyb/mykey.key'  # 指定文件路径
c.IPKernelApp.pylab = 'inline'    # 所有matplotlib的图像都通过iline的方式显示
c.NotebookApp.port = 8888     # 运行的端口

• 查看端口是否占用脚本

netstat -anp|grep 8888

启动jupyter

nohup jupyter notebook &

注：可以写入 sh 脚本，然后设置开机自启

设置阿里云安全组（非阿里云用户无需这一步）

在控制台-云服务器ESC-实例 选择自己的主机点击本实例安全组-安全组列表-配置规则-入方向-手动添加添加如下图所示配置
注：其中端口号填写自己设置的端口

✨更换Logo

图片地址：

/usr/local/lib/python3.5/dist-packages/notebook/static/base/images/logo.png

👍安装扩展插件

github地址

pip3 install jupyter_contrib_nbextensions

pip3 install -U six

jupyter contrib nbextension install --user

📢内核管理

常用操作

查看以安装内核的信息

jupyter kernelspec list

卸载

卸载指定名称的内核，比如： java

jupyter kernelspec remove java

删除

jupyter kernelspec uninstall java   #java  

安装多版本python内核

安装多个py内核后就能像虚拟环境一样运行不同版本的代码了，在jupyter 新建文件时可以选择不同的内核版本，也可以在上方菜单栏点击Kernel - > Change kernel 切换当前内核。

当前场景：以在python3 中安装了jupyter，需要安装 python2 的内核

1. 在python2（虚拟环境也可）下安装 ipykernel

python2 -m pip install ipykernel

2. 安装内核到jupyter 中

python2 -m ipykernel install --user --name py2 
# --user安装到当前用户，可查看帮助选择不同安装位置，也可不加该参数，安装到默认位置。--name为内核命名为py2

3. 查看

jupyter kernelspec list

4. 重启jupyter

🚀支持C++内核( 需要minicanda或者新建虚拟环境）

利用windows子系统（WSL）或者Linux中

（利用Win10子系统可视化开发环境搭建可参考鄙人文章）

1. 从windows应用商店里安装Ubuntu子系统

2. 安装 Miniconda

这里使用 xeus-cling，安装说明指出需要 Miniconda，因为 Anaconda 会有冲突，因此我使用 Miniconda，已经装过 Anaconda 的可以尝试一下用 Anaconda 安装。

在这里找到需要的 Miniconda 版本，然后复制链接：
https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html

通过命令行或者开始菜单打开上一步中安装的 Ubuntu，输入下列命令。

wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

出现 License 之后按 q，输入 yes 允许许可，然后 Enter，如果要改路径就自行修改。然后输入 yes 完成初始化

输入which python 发现python路径与Windows里的python路径是隔离的，并不冲突。终于发现子系统的好处了😂。

https://github.com/QuantStack/xeus-cling

安装：

conda install xeus-cling -c conda-forge

安装完之后再次打开 Jupyter notebook，可以在 New 按钮下看到多了 C++11，C++14 和 C++17，新建一个 C++14 notebook，输入一些 C++ 代码，Shift + Enter 可以得到运行结果，没有报错就大功告成了！

☕支持Java

环境准备：

1. Java JDK >= 9，注意不是jre

i. 检查java环境

> java -version
java version "9"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 9+181)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 9+181, mixed mode)

ii. 接下来，确保Java位于jdk的安装位置，而不仅仅是jre, 使用java --list-modules .输出列表应当包含jdk.jshell.

• On *nix java --list-modules | grep "jdk.jshell"

• 在 windows上: java --list-modules | findstr "jdk.jshell"

应当输出jdk.jshell@

如果没有，请输入java -verbose检查第一行或者最后一行的java路径信息，确认java在JDK路径下，而不是JRE中。

2. 不限类似jupyter的环境

• Jupyter
• JupyterLab
• nteract

安装

1. 下载地址：https://github.com/SpencerPark/IJava/releases

可选择下载压缩包：ijava-$version.zip

2. 解压，看到文件install.py 和 一个java文件夹

查看安装帮助：

python3 install.py -h

安装：

python3 install.py --sys-prefix

其他安装选项：--default, --user, --sys-prefix, --prefix, --path, or --legacy,不同选项对应不同安装位置。

查看已经安装的内核，应当包含java，如图：

jupyter kernelspec list

[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-Vdu3CRBV-1596160912130)(assets/untitled.png)]

使用

导包：
直接导入

%jars import org.slf4j.Logger;
%jars import org.slf4j.LoggerFactory;

maven 导入

%%loadFromPOM
<dependency>
  <groupId>ch.qos.logback</groupId>
  <artifactId>logback-core</artifactId>
  <version>1.2.3</version>
</dependency>

import ch.qos.logback.core.Layout;

或者

%maven org.slf4j:slf4j-api:1.7.25 ch.qos.logback:logback-core:1.2.3 ch.qos.logback:logback-classic:1.2.3

import org.slf4j.logger;

支持javascript

项目地址： https://github.com/n-riesco/ijavascript

• 依赖：Node.js、npm

  sudo apt-get install nodejs npm

安装

npm install -g ijavascript
ijsinstall

支持Node JS - jupyter-nodejs

项目地址：https://github.com/notablemind/jupyter-nodejs

使用效果：Example

安装依赖

• IPython 3.x

• pkg-config

  sudo apt install pkg-config

• 安装Node

  sudo apt-get install nodejs
  sudo apt-get install npm

• 检查node-gyp 是否安装

  node-gyp list

  未安装请自行百度安装

• 安装ZeroMQ：

  apt-get install libzmq3-dev

  其他安装方式： https://zeromq.org/download/

安装

git clone https://github.com/notablemind/jupyter-nodejs.git --depth=1
cd jupyter-nodejs
mkdir -p ~/.ipython/kernels/nodejs/
npm install && node install.js
npm run build
npm run build-ext

尝试

jupyter console --kernel nodejs

👍其他内核支持

https://github.com/jupyter/jupyter/wiki/Jupyter-kernels