在线作图|在线做零模型分析（null model）

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于 2021-11-05 08:46:10 发布

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文章标签： R R studio

本文链接：https://blog.csdn.net/weifanbio/article/details/121144253

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零模型分析是评估生态群落组装过程随机性与确定性的工具，常用于比较不同环境条件下的组装过程。本文介绍了如何使用R语言以及云图图（cloudtutu.com）在线平台进行零模型分析，包括betaMNTD、betaNTI、Raup-Crick等指数的计算，并展示其可视化结果。用户可以上传txt或csv文件，平台支持在线修改分组名称，生成PDF和PNG格式的可视化结果。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

零模型（Null model）

零模型（null model）是一种对装配过程进行定量比较的方法。例如，集合群落结构（EMS）方法的目的的要素来区分那些物种分拣过程组装随机组装社区，基于发生率 (Raup-Crick) 的 beta 多样性 (βRC ) 已被用于区分确定性和随机组装过程。此外，基于系统发育相关性表明共享环境响应特征的假设，零模型方法已扩展到整合系统发育信息(Using null models to compare bacterial and microeukaryotic metacommunity assembly under shifting environmental conditions)。本网站零模型工具包括betaMNTD、betaNTI、Raup-Crick、Bray-curtis等指数计算并最终以箱线图的形式展示其可视化结果。
在这里插入图片描述

应用举例

Figure 1. (B–D) Tree null model approaches were applied. (B) EMS identifes metacommunity properties emerging in site-by-OTUs incidence matrices. © Incidence-based (Raup-Crick) beta-diversity (βRC) tests stochasticity and determinism using a metric provide

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