来自NCBI GEO原始数据上传的一个“bug”！

现在发文章，如果使用了测序，芯片等技术，杂志社一般会要求你将原始数据上传到公共数据库中，以保证数据的真实性和可重复性，常见的公共数据库有：

NCBI GEO（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo）

EBI ENA（https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/guides）

中国自己的国家基因组科学数据中心（https://ngdc.cncb.ac.cn/?lang=zh）等。

个人推荐支持国货，中文界面，qq群支持（虽然从来没有用过，）

最近在整理数据时候（其实是被人投诉了），发现了GEO使用中一个不算bug的bug，分享给大家！

先看下注册GEO账号时，你的个人信息页面，如上图所示。下面有段英文，从来没关注过，大坑啊！

NCBI GEO个人信息页面截图

我们随便打开个页面，例如GSE165163页面，观察下，红色矩形部分的信息来自哪里呢？细心的小伙伴已经发现，这个信息，跟GEO Profiler中的个人信息是一致的，并且是同步的，也就是你修改GEO Profiler中的信息，在GEO的页面上会实时显示出来。

NCBI GEO GSE165163页面

这就会带来一个问题：

假如你的数据不是你自己上传的，而是由其他人帮你上传的（例如你朋友，测序公司等），那么在你没有给对方你的GEO账号情况下，你的数据在GEO页面上的联系人信息，就由对方所控制了。假如你朋友，或测序公司使用他自己的账号给你上传，那么我们来看下 My submissions页面，以下是我帮助朋友/客户上传的数据集。当我点开下面的N个GSE页面后，发现所有我账号下上传的数据集（例如这里的6套数据）的联系信息，包括邮箱，地址等全都是我自己的（小伙伴们可以试试看）。

已提交数据集列表

那么，问题来了：本应该是我朋友/客户的数据，联系方式不应该是他么？怎么在NCBI GEO中变成统一的了。

细思极恐，比如我在不同时间帮助100个来自世界各地的朋友/客户，上传了100套数据。会出现以下两种情况：

1. 我的个人信息从来没有改过，那么这100套数据的联系人全都是我，100个客户找你理论：“我的数据，交给你上传，怎么联系人是你？那么这数据到底归谁所有？你把账号，密码给我！”

吐槽：我只有1个账号，怎么给你们100个人？谁叫你懒，连个账号都不注册?!

1. 每次上传前都根据朋友/客户信息，修改自己的信息，那么bug来了，这100套数据的联系人信息，全都变成你最后一次保存的信息了。100个客户找你理论：“我的数据，交给你上传，怎么联系人是别人，邮箱也是别人，你把我数据卖了吗？”

基于NCBI GEO页面信息调用GEO Profiler的现状，还真没办法将100个朋友/客户的信息一一改成他们自己的姓名，邮箱，地址。

我们将GEO这个不算bug的bug，称之为“没有历史版本的个人信息设置”，谁在10年间还不换个邮箱，换个单位么？

小伙伴们想想：就比如说某个人的数据，自己上传的。10年前，他在北京大学做的数据，GEO页面应该显示北京大学吧；5年前他在上海交大做的数据，GEO页面应该显示上海交大吧；3年前他来到了浙江大学，GEO页面应该显示浙江大学吧，要不给你经费的人不愿意啊！

那么当打开页面后会发现，北大和交大全都变成了浙大！！！

北大，交大找你理论：怎么N年前不是我给的钱吗？GEO页面怎么是浙江大学的地址？

所以，科研，勿懒！在这个bug没解决前，还是老老实实，一套数据注册一个账号吧！

问题又来了，作为每年上传几百套数据的人，臣我哪里来几百个email进行注册啊！

                    

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