wps怎么画网络图_在线四步绘制朱樱花网络图附示例数据

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云平台网址:https://www.omicstudio.cn/tool/56

本教程主要讲解上面的例图的制作过程,一共四步,操作时间约20分钟,B站视频实操地址:https://www.bilibili.com/video/BV1w64y1c7Gg。您可以先学习例图的绘制方法,再替换成您的数据,更容易上手。

c490f5780f3b4e45d434d55dff79f4d3.png 为什么是朱缨花图? 如上例图,出现在文章中极具震撼力,每一片花瓣对应一个核心节点,有限的节点数对应大量的子节点,形成了花团锦簇的效果,更突出了核心节点(字母A-F)的重要性。从本质上来说,这只是一个网络图,但网络图也有很多不同形式,其表现力也不同,当您的数据存在有限的几个重要对象(如miRNA,蛋白等),其又存在一对多的关系时(如miRNA靶向的转录本,蛋白参与影响的众多通路等),就非常适合用朱缨花图来呈现,以下是相同数据的不同布局,可以对比一下: a73de8594c7e4925556abe0bc17c1464.png c490f5780f3b4e45d434d55dff79f4d3.png 材料准备 (1) 示例数据 需要的示例输入文件可以扫码得到: 链接:https://pan.baidu.com/s/1Z-Dvd4wK1-P5O-ZvV6gkJA 提取码:tx34 17d3255ba7c533bc2ea3923b1bf545cc.png 下载得到的示例数据内容如右图,其中,“OmicStudio-朱缨花图输入文件.xlsx”是基础输入数据,“node.xlsx”和“edge.xlsx”是高级属性输入数据。 db6889b555ffbdfae76ec9ed4da516aa.png “朱缨花图.*”(*指代tiff、pptx、png、pdf和docx)是绘制得到的结果,其中png和tiff是非矢量图(像素分别为600dpi和300dpi,足够发文),pdf 、pptx和docx是矢量图,可以先看下效果再决定是否阅读后续内容。 (2) 绘制方式:https://www.omicstudio.cn/tool/56。免费注册,免费使用。以下为工具界面。 8e890abc835e61577534ec3b10b2ce7b.png 539d0491fe9e796f9f782de2cbf13f7d.png c490f5780f3b4e45d434d55dff79f4d3.png 一分钟出图演示 1. 上传基础输入数据:绘图数据-不使用示例数据-输入文件-上传“OmicStudio-朱缨花图输入文件.xlsx”。 d61d2ec9f27d55662b42bfb23dce6866.png 2. 上传高级属性文件:参数调整-图形调整-需要自定义调整节点以及边属性-上传“node.xlsx”和“edge.xlsx”。 921fd2f64874e329240225820fdb01df.png 3. 像视频中演示的,这三个文件上传完成后再稍做调整便可完成绘制。整个过程就是这么简单,所以, 重点是高级属性文件(“node.xlsx”和“edge.xlsx”)如何整理。往下看吧。 -------------------------------- 正题分割线 ---------------------------------    1. 上传基础输入文件,下载高级属性文件 上传基础输入文件后,在“ 参数调整-图形调整 ”中设置布局为“ stress ”,可以得到如图效果。 0ea374b945a8bb34b28572f98382ed19.png 目前,形状已经有了,还需要对每一片花瓣着色。着色方法是,在“ 是否需要自定义调整节点以及边属性 ”中先下载“ edge.xlsx ”和“ node.xlsx ”文件。这两个文件是根据您的文件自动生成的属性默认参数,当有什么功能是页面参数无法满足的,直接修改此文件中的值,然后原位上传即可。修改方法见下文。 2. 修改点属性(颜色,点大小,标签) 从上图中我们可以注意到,有五个红色的核心节点,我们需要做的是在点属性中分别找到核心节点对应的子节点,然后分别附不同的颜色值。 我们 先观察输入文件 :绿框、红框和蓝框分别对应基础输入文件、node.xlsx和edge.xlsx。默认出图只有两种颜色是因为红框第二列(group)默认只有两种分类(Source和Target),与此对应的,字号(size)、颜色(color)和点类型(node_type)都只有两种。若要改变点颜色,我们就需要把红框中的主节点对应的子节点都找出来,然后赋相同的颜色值,比如,绿框中已经指明,A(第一列,1-10行)对应a1-a10(第二列,1-10行),就需要把红框中的A和a1-a10都找出来,赋相同的颜色值,同理,蓝框中边的颜色也需要用这种方式来修改。 4624a0bbdd40cdee8bcfcf3b9bc6ab5d.png 接下来,我们看如何方便快速地操作(A.重设分组,group列;B.重设颜色,color列;C.重设点大小,size列;D.重设label列): A-1 .如截图,我们需要在I列匹配出A列的主节点,K列和L列是基础输入数据中定义的关系对(关系对怎么整理我们最后说),我们复制到此表备用。接下来我们需要在I列写一个函数: INDEX(需要匹配得到的列,MATCH(待匹配对象,带匹配对象所在列,0代表精确匹配)) 。不要问为什么这么写,问就是这么写就对了,这个操作后面会重复好几次,做一遍下来就背得啦。 2d20058a9fefe653b898ff70cf98e537.png A-2 .填完函数后,在此格子右下角双击,让函数在此列批量复制,于是节点的对应关系就找到了。 A-3 .通过公式找到对应关系后,需要把数据复制到B列(group列),这样,归属于一组的点就有了相同的组名。 B-1 .现在,我们已经将分组设置成了A-F六组,于是我们要选6个颜色: 可以直接点击这个地址 https://www.omicstudio.cn/doc/431,也可以从云平台找到配色方案,路径如下: c64eb9e3c5191bae2dee03b37c1f641f.png 快速找到好看的配色方案的方式如图,随意选一行颜色即可。 1f7d28df7c54fe6ea58cfad0c8dfcbaf.png B-2 .批量给颜色赋值的方式同A: C .子节点(花瓣)的直径小一点图片整体更好看; D .子节点(花瓣)的标签去掉更合适。 做完以上,就得到百度云盘中的node.xlsx文件啦。 3. 修改边属性(颜色) 对edge.xlsx文件进行处理,方法同上。 做完以上,就得到百度云盘中的edge.xlsx文件啦。 4. 图片美化与下载 现在美中不足的是图片偏扁,我们可以把宽高调成一样来调整图片比例。图片宽高调整和下载功能都在“ 结果下载 ”模块中。docx和pptx模式下每一个元素(点、边)都可以单独调整,非常方便进行个性化设置。 -------------------------------- 正题分割线 --------------------------------- c490f5780f3b4e45d434d55dff79f4d3.png 关于如何用自己的数据重现上述朱缨花图 首先需要明确一点,只有 数据情况符合“少数几个主节点各自对应大量子节点 ”这样的情况才有可能做出朱缨花图。比如,miRNA和mRNA存在一对多的关系(靶向),如果精心挑选几个miRNA,这些miRNA各自又靶向众多mRNA,做出来的效果就会很接近例图。反之,蛋白和基因之间一般是一对一的关系,那么不会绘图方式如何处理,都无法做出花团锦簇的效果。 当数据情况符合时,只要 上传关系对 ,云工具会自动做出一张图,布局选择“stress”即可得到雏形。然后下载“node.xlsx”和“edge.xlsx”得到有默认值的属性文件,在这此基础上用上述方法进行修改,即可做出朱缨花图。 c490f5780f3b4e45d434d55dff79f4d3.png 关于此云工具的更详细说明 B站直播:https://www.bilibili.com/video/BV1w64y1c7Gg 微信稿:https://mp.weixin.qq.com/s/tjxMzAw9QlXkkKb7dM3q8A c490f5780f3b4e45d434d55dff79f4d3.png 关于OmicStudio的更多在线工具学习资料 e8764a85e3ed68c4f6342565add1a47c.png cf871d8d71d7c9aab32e6c28266dafcb.png相关阅读 玩转GO和KEGG富集因子图的N种姿势:3种数据处理(含在线筛选条目),3种排序方式,本地交互图片 云平台在线绘制Circos圈图:丰度表类型 | OmicStudio重磅云工具 SCI必备|一分钟就能完成多组学网络关系图,了解下|OmicStudio开挂绘图 SCI必备|高分文章中颜值爆表的circos图不用代码也能画|OmicStudio开挂绘图 小姐姐教你基因ID转换 | 生信快闪 跟着小姐姐一起学习如何做GO和KEGG基因功能富集分析 | 生信快闪

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