Q1:什么是网络分析(Network Analysis)?
网络分析(Network Analysis)是通过计算特征值间的相关系数,寻找变量之间的联系,以网络图或者连接模型(connection model)来展示数据的内部结构,并将显著相关的特征节点用不同粗细的线相连来表示不同变量(物种或基因等)间的相互作用关系。从而简化复杂系统并提取有用信息的一种定量分析方式。在生态学中常利用相关性来构建网络模型,可以使用一个数据集例如物种群落数据进行分析,这时候展现物种之间的共出现模式(co-occurance pattern),也可以结合多个数据集进行分析,例如分析环境因子对物种的影响等。
组间的网络分析反应相同样品内部不同指标的相互关系,如:微生物物种与抗生物抗性基因的关系等。网络分析图中,每一个元素(物种、基因或者环境因子等)可以描述成网络中的一个节点,他们之间的关系被描述成网络中的边 。随着高通量测序技术的普及,网络分析被越来越多的科研工作者使用。构建相关性网络,首先需要计算不同变量之间的相关系数矩阵,然后根据相关系数确定变量之间的网络连接,计算node值和line值,从而绘制网络图。
Q2:如何在线画一个网络组间网络分析图?
小编和他的小伙伴们开发了一个在线的作图小网站——云图图(www.cloudtutu.com,免费的哦~),操作步骤如下:
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