数据库numeric_TCGA数据库:生存分析

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我们前面介绍了TCGA数据库中各种数据的下载处理:

TCGA数据库:RNA-Seq数据的下载与处理

TCGA数据库:SNP数据的下载整理及其可视化

TCGA数据库:miRNA数据下载与整理

TCGA数据库:临床数据下载与整理

TCGA数据库:ATAC-Seq数据的下载整理及其可视化

一文解决TCGA数据库临床数据下载与整理

也介绍了下游的差异分析:

TCGA数据库:GDCRNATools包下载数据、处理数据以及差异分析

一文就会TCGA数据库基因表达差异分析

也介绍了:基因表达谱热图绘制

本文介绍生存分析,其实,在R中,生存分析很简单,大家在网上能找到无数的文章。利用survival包就可以。就是按照下列公式就可以完成简单的生存分析。

fit ~ 分组, data=数据框)

我们这里就结合基因的表达量,来进行分析。

首先加载我们的数据。

options(stringsAsFactors = F)#加载表达数据load("F:/TCGA/HTSeq-FPKM/Rd
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