到底什么是eQTL?
eQTL和QTL之间有什么联系?为什么说QTL比eQTL难很多?
QTL和GWAS有什么关系?
GTEx数据库里的eQTL数据如何利用?
说eQTL之前必须先解释QTL,QTL,一说到中文名就清楚了,数量性状位点,就是一个性状,比如身高,会由成百上千个基因来决定,目的简单明确,那么我们如何找到这些位点呢?
Quantitative Trait Locus (QTL) Analysis - 来自nature的介绍
实现层面,其实研究的不是基因,而是染色体上的区段,更明确的说就是分子标记,SNP最流行,大学里还学过很多烦人的分子标记。
关联是关键,association,基本假设就是遗传片段会跟表型一起分离。
通常极少数的loci具有很高的effect size。
选择足够纯的亲代(需要有基因型和表型的差异),然后不断杂交,后代的基因型和表型会不断的分离重组。
然后对基因组的每个位点做统计检验,得出likelihood ratio,从而