docker 安装依赖_生信软件部署费时费力？Docker来帮你

IT领域里面经常可以听到人们谈论，“不重复造轮子”。刚好课题组最近购买了新服务器，这不又要开启安装一系列杂七杂八的软件。有的软件是真心难搞，不是编译出问题就是各种依赖包不对，整下来光把时间精力耗在了软件部署上了。思前想后，有很多喜欢用conda安装各类生信软件的童鞋。怎么说呢，也不失为一种“一键安装”的妙招。其实很久前就在各大IT网站平台看到过docker的各种技术帖，也曾想过是不是可以把这种技术运用到生信的软件部署中来。赶巧了，在搜索docker的使用和软件部署教程时，发现了华为云的帖子https://blog.csdn.net/devcloud/article/details/93167954，恰恰契合了我很久之前的想法！

Docker是一种容器技术，是可以运行在主机内核之上又不依赖于主机系统的手段。将容器与主机系统隔离可以避免多用户下文件系统的混杂，同时一台主机又能创建数百上千个容器。不仅是后期应用迁移时省心省力，还能在不花费大量时间精力的前提下重复生信分析，要知道生物学最讲究可重复性。

下面进入主题，首先是在linux系统下安装docker

###install docker###更新apt包索引$ sudo apt-get update###安装 apt 依赖包，用于通过HTTPS来获取仓库:$ sudo apt-get in