怎么让热图显示基因名_如何将 qPCR 数据做成热图

本文介绍了如何使用HEML软件将qPCR数据转换为热图,包括数据整理、软件操作步骤、颜色定制、归一化处理等,帮助没有R语言基础的用户便捷展示基因表达变化。
摘要由CSDN通过智能技术生成

做了一堆的实时定量 PCR,然后有一堆的数据,那不是要做一堆的柱状图,我想把这些结果都放在一起怎么办呢?那么我又不会高大上的 R 语言,那么咋整呢。

今天我给大家介绍一个比较简单的热图制作软件 HEML。

首先,把所有数据算好以后,在 excel 中排列好,如下:

将 excel 保存成 2003 版, 这个很重要,只有 03 版才能够被识别, 将文件命名为 gene。然后打开 HEML 软件。

打开 File——load (图中红色框框),将要打开的文件类型选择为 word 2003,打开我们之前保存的 gene 文件。

选择数值,如果需要显示 Y 轴和 X 轴标题,可以在下方的框框里打勾。

然后加载完以后是初步的热图就出来啦,觉得有点丑,需要进行下一步的美化。有两个方法,第一个方法是可以点击 SET,会弹出一个小框(1),选择 select 可以挑选自己喜欢的颜色。第二个方法需要在加载数据前就先设定好模板即(2)中 DEMO 按钮,点击以后会出现预设好的模板,挑选满意的模板然后加载数据。

除了调节颜色以外,还能够对热图的大小和边距以及 XY 轴进行调整,如图所示。

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