linux作业管理系统pbs,集群上作业提交系统LSF和PBS的使用与简介

集群上作业提交系统的使用与简介

LSF作业提交系统

bsub：作业提交

通用方法

bkill：删除作业

bjobs：查看作业

bqueues：查看队列信息

PBS作业提交系统

qsub：作业提交

通用方法

qdel：删除作业

qstat：显示作业状态

pbsnodes：显示集群中所有节点信息

LSF作业提交系统

bsub：作业提交

通用方法

#BSUB -n num

#BSUB -l nodes=1:ppn=1

#BSUB -q queue

#BSUB -o path

#BSUB -e errorPath

#BSUB -J jobName

#BSU -I

-n：指定num为计算核心数

-q：指定queue队列

-o：将标准输出重定向到path

-e：将标准错误信息重定向到errorPath

-J：指定jobName为作业名称

-I：交互模式

bkill：删除作业

删除作业12345：

bkill 12345

bjobs：查看作业

bqueues：查看队列信息

PBS作业提交系统

PBS是一个作业调度系统，常用于分布式高性能计算集群的作业管理。

qsub：作业提交

通用方法

在集群上使用qsub run.pbs提交作业，run.pbs一般包括这些信息：

#PBS -N jobName

#PBS -l nodes=1:ppn=1

#PBS -q queue

#PBS -o path

#PBS -e errorPath

#PBS -l walltime=800:00:00

cd ./home/myJob

./job

-N：指定jobName为作业名

-l：用来定义资源列表，nodes=1指定该作业运行的节点数量为1，ppn=1指定每个节点需要1个cpu。walltime指定作业运行时间，800：00：00代表800个小时。

-q：指定queue队列

-o：将标准输出重定向到path

-e：将标准错误信息重定向到errorPath

最后两行是进入作业目录并执行该作业

qdel：删除作业

删除作业12345：

qdel 12345

强制删除作业12345：

qdel -p 12345

15s后删除作业12345：

qdel -W 15 12345

qstat：显示作业状态

查看所有作业：

qstat -q

查看作业12345：

qstat -f 12345

pbsnodes：显示集群中所有节点信息

查看闲置节点：

pbsnodes -l free