Java画韦恩图_R绘制韦恩图 | Venn图

本文介绍了使用R语言的VennDiagram库来绘制韦恩图的步骤,包括设置填充颜色、透明度、图像类型等,并强调了主流韦恩图工具通常仅支持5个类别的限制。此外,还提到了其他选项如网页版和需要安装rJava的venneuler包。
摘要由CSDN通过智能技术生成

解决方案有好几种:

网页版,无脑绘图,就是麻烦,没有写代码方便

极简版,gplots::venn

文艺版,venneuler,不好安装rJava,参见Y叔

酷炫版,VennDiagram

特别注意:

目前主流的韦恩图都只支持5个类别,多了不能使用韦恩图。

UpSet某种程度上可以显示多于5个类别,但是结果不是很直观,不推荐。

library(ComplexHeatmap)

m = make_comb_mat(venn.list)

UpSet(m)

1. 网页版的就不说了,非常简单,直接输入数据就行;

R版的输入都是一种数据结构list,可以单独出来。

2. 极简版

options(repr.plot.width=4, repr.plot.height=5)

vp

Gup=names(moduleListG_DEG[["up"]]), Gdown=names(moduleListG_DEG[["down"]])))

3f9e11639ffb201a6595301774f88655.png

3. 还没成功过,需安装rJava,代码如下:

set.seed(2017-11-08)

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