在linux系统下怎么下载sra数据库,ascp咋啦?如何从NCBI上下载sra数据?

前言

今天(3.12日),想在NCBI上下载lncRNA数据,突然发现软件Aspera的ascp(报错:ascp: Failed to open TCP connection for SSH, exiting)下载不了。

百度一波,这种问题很少。随后问了身边的小伙伴,大家都没及时回复。

然后就问了外校的小伙伴,发现一样的报错,考虑应该是NCBI在维护。

问题来了,除了ascp以外,其他下载方式有哪些呢?

pengzw@super-server:~/data/ncbi$ ascp -T -l 200M -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -T --mode recv --host ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov --user anonftp --file-list ./download_list.txt ./

ascp: Failed to open TCP connection for SSH, exiting.

Session Stop (Error: Failed to open TCP connection for SSH)

1.Aspera高速下载

①简介及安装:由于下载时,官方自动检测系统,linux最新版是师弟在ubuntu上下载传给我。

wget https://download.asperasoft.com/download/sw/connect/3.8.1/ibm-aspera-connect-3.8.1.161274-linux-g2.12-64.tar.gz

tar zxf ~/downloads/ibm-aspera-connect-3.8.1.161274-linux-g2.12-64.tar.gz -

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