距离分析导出_干货 | ImageJ分析时间序列图像

本文详细介绍了如何使用ImageJ软件分析时间序列图像,特别是针对荧光强度变化的测量。通过打开和校准图像,选择ROI,使用Time Series Analyzer插件获取平均荧光强度,最后在Excel中绘图展示数据变化。同时提到了Excel的EasyCharts插件用于美化图表,并介绍了导出高分辨率图片的方法。

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ImageJ系列最新教程

ImageJ(官网:https://imagej.nih.gov/ij/)是由美国National Institutes of Health(NIH)开发的免费开源的公共图像处理软件,在生物及医学图像分析中起着非常重要的作用。

在我们以往的分享中我们已经给大家分享了使用ImageJ分析荧光共定位、细胞计数、免疫组织化学的定量、轨迹追踪、线粒体形态学测量等使用教程,有需要的小伙伴可以去往期查看。

活细胞工作站或共聚焦显微镜可方便获得实时、原位、动态的时间序列图像或视频,今天给大家分享使用ImageJ分析时间序列图像。

下图是Elife(IF=7.616)中记录时间依赖的钙成像,横坐标是时间纵坐标是钙信号,反映的是不同时间点钙信号的动态变化:

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分析步骤

1.待分析时间序列图像的打开

1.1 视频文件的打开

打开ImageJ软件,打开.avi格式的时间序列动态视频,进入AVIReader界面:

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本示例视频共有120帧,视频时间范围为0分钟至119分钟。读取所有帧即从First Frame到Last Frame。Flip Vertical为打开视频时垂直翻转。选择Use Virtual Stacke,点击OK,即可打开视频:

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当前显示的是视频中120帧的第65帧

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