基因共表达网络分析java,WGCNA 加权基因共表达网络分析教程(1)

本文介绍了如何在RStudio中进行WGCNA基因共表达网络分析,包括安装Rstudio,加载WGCNA包,处理和检查数据中的缺失值,以及进行样本聚类和临床特征分析。通过示例代码详细展示了数据导入、预处理和可视化的过程。
摘要由CSDN通过智能技术生成

学是很多做科研的同学都想学的,包括我在内,现阶段正在学习这个,深夜整理材料不易,请多多关照支持!

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先安装Rstudio以及以及加载WGCNA数据包

Rstudio软件下载地址:

WGCNA加载按照网站步骤操作:

Workshop可以在rstudio菜单栏的session-set working directory 选择你要工作的文件夹,要读取的CSV等文档都只能放在设置的working directory。

蓝色#表示注释行,黑色是代码,运行代码时的每一行命令是不需要分号“;”。

以下是代码数据,这个是我看学习的教程,有些我也不懂,粘贴出来一起学习。

1.a Loading expression data

# Display the current working directory

getwd();

# If necessary, change the path below to the directory where the data files are stored.

# "." means current directory. On Windows use a forward slash / instead of the usual \.workingDir = ".";setwd(workingDir);

# Load the WGCNA pack

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