来到上海工作的这四个月所做的所有工作都是围绕MAnorm展开的,这是我的导师开发的一个算法,用于分析两个测序样本间的差异。我用两个星期的时间用python实现了这个算法并在接下来的时间里测试使其稳定,其中重构过一次。后来我发现使用cython以及多进程多线程可以使得速度再加快许多,所以这段时间的工作就是想在速度上可以提升很多,预期是3倍左右的提升。
转载于:https://my.oschina.net/semal/blog/196142
来到上海工作的这四个月所做的所有工作都是围绕MAnorm展开的,这是我的导师开发的一个算法,用于分析两个测序样本间的差异。我用两个星期的时间用python实现了这个算法并在接下来的时间里测试使其稳定,其中重构过一次。后来我发现使用cython以及多进程多线程可以使得速度再加快许多,所以这段时间的工作就是想在速度上可以提升很多,预期是3倍左右的提升。
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