参考文章:
老菜鸟终于开始进行CHIP-seq的学习啦,又是开始学习新的软件。不过现在感觉没那么头大了,毕竟前边学了一些了。先做些简单的记录吧。
1.安装软件
安装仍然在服务器中使用miniconda进行安装,参考文章RNA-seq流程学习笔记(3)。
2.Bowtie2软件的使用
1. 软件说明
bowtie2 --help
Usage:
bowtie2 [options]* -x <bt2-idx> {
-1 <m1> -2 <m2> | -U <r> | --interleaved <i> | -b <bam>} [-S <sam>