多组柱状图_堆叠柱状图各成分连线画法：突出展示组间物种丰度变化

堆叠柱状图连线画法

提出问题

宏基因组之前转载了中科院生态中心邓晔组的文章《土壤细菌定量方法结合相对丰度分析揭示种群的真实变化》。其中的图3基于堆叠柱状图，添加组间各成分连线，可以更容易的观察和比较组间的变化。如下图：

我在很多文章中也见过，一直没有学会具体的做法。这回正好身边的人会做，就问了一个作者，结果回复是origin画的，有个选项就可以添加组间连线。

现在方法是有了，不过我还是喜欢用R来画图，因为每一个细节的修改都落实的代码上，可见可重复。

而窗口操作类的软件，操作过程是不容易被记录的，别人也很难重复。

我下午将此问题放在了宏基因组0讨论群中，问是否有R包或现成的函数一句话实现在堆叠图中添加组间连线。

获取专业解答

李陈浩老师首先説写两句R就搞定。可是以我的R水平，虽然学过R in action，还只是会按帮助使用包，修改代码的水平，很难写代码实现想法。

同时李海敏、沈伟等几位老师，也提供了众多解决方案，如ggalluvial，这个更炫酷，功能过于强大，我会在下一次分享中把中文笔记和使用心得带给大家。

到了晚上，新加坡的李陈浩老师己经将我想要的功能帮助写好了，大赞。如下，我略微修改并注释：

# 安装和加载tidyverse包
install.packages("tidyverse")
library(tidyverse)

# 生成测试数据
df=data.frame(
  Phylum=c("Ruminococcaceae",&#