TSNE——目前最好的降维方法

本文介绍了TSNE(t-distributed Stochastic Neighbor Embedding)作为流形学习的一种,是高维数据降维和可视化的优秀方法。TSNE通过保持高维和低维空间中样本分布的概率相似性,解决了拥挤问题。文章讨论了流形学习的基本概念、分类,重点展示了TSNE在MNIST数据集上的应用,并与其他降维算法的效果进行了对比。
摘要由CSDN通过智能技术生成

转自:http://blog.csdn.net/u012162613/article/details/45920827

1.流形学习的概念

流形学习方法(Manifold Learning),简称流形学习,自2000年在著名的科学杂志《Science》被首次提出以来,已成为信息科学领域的研究热点。在理论和应用上,流形学习方法都具有重要的研究意义。

假设数据是均匀采样于一个高维欧氏空间中的低维流形,流形学习就是从高维采样数据中恢复低维流形结构,即找到高维空间中的低维流形,并求出相应的嵌入映射,以实现维数约简或者数据可视化。它是从观测到的现象中去寻找事物的本质,找到产生数据的内在规律。

以上选自百度百科

简单地理解,流形学习方法可以用来对高维数据降维,如果将维度降到2维或3维,我们就能将原始数据可视化,从而对数据的分布有直观的了解,发现一些可能存在的规律。

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官方代码思想是一遍聚类一遍降维,其实也是一种比较好的自动聚类方法。

高维数据每个数据点被认为是一种正太分布数据(正太有三好),低维数据同样,然后让高维数据和低维数据相似度最大。又因为t分布好算而且和正太分布逼近,所以用了t分布来算就成了tsne方法。

"

2.流形学习的分类

可以将流形学习方法分为线性的和非线性的两种,线性的流形学习方法如我们熟知的主成份分析(PCA),非线性的流形学习方法如等距映射(Isomap)、拉普拉斯特征映射(Laplacian eigenmaps,LE)、局部线性嵌入(Locally-linear embedding,LLE)。

当然,流形学习方法不止这些,因学识尚浅,在此我就不展开了,对于它们的原理,也不是一篇文章就能说明白的。对各种流形学习方法的介绍,网上有一篇不错的读物(原作已找不到): 流形学习 (Manifold Learning)

3.高维数据降维与可视化

对于数据降维,有一张图片总结得很好(同样,我不知道原始出处):

这里写图片描述

图中基本上包括了大多数流形学习方法,不过这里面没有t-SNE,相比于其他算法,t-SNE算是比较新的一种方法,也是效果比较好的一种方法。t-SNE是深度学习大牛Hinton和lvdmaaten(他的弟子?)在2008年提出的,lvdmaaten对t-SNE有个主页介绍:tsne,包括论文以及各种编程语言的实现。

接下来是一个小实验,对MNIST数据集降维和可视化,采用了十多种算法,算法在sklearn里都已集成,画图工具采用matplotlib。大部分实验内容都是参考sklearn这里的example,稍微做了些修改。

Matlab用户可以使用lvdmaaten提供的工具箱: 

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