python如何计算分子描述符_Python mordred包_程序模块 - PyPI - Python中文网

as命令

计算所有描述符$ python -m mordred example.smi

name,ECIndex,WPath,WPol,Zagreb1, (snip)

benzene,36,27,3,24.0, (snip)

chrolobenzene,45,42,5,30.0, (snip)

保存到文件(显示进度条)$ python -m mordred example.smi -o example.csv

50%|███████████████████████████████████████▌ | 1/2 [00:00<00:00, 7.66it/s]

流读取(内存不足，没有分子信息)$ python -m mordred example.smi -s -o example.csv

0it [00:00, ?it/s]

仅限ABCIndex$ python -m mordred example.smi -d ABCIndex

name,ABC,ABCGG

benzene,4.242640687119286,3.9999999999999996

chlorobenzene,5.059137268047012,4.785854275382693

abcindex和酸碱性$ python -m mordred example.smi -d ABCIndex -d AcidBase

name,ABC,ABCGG,nAcid,nBase

benzene,4.242640687119286,3.9999999999999996,0,0

chlorobenzene,5.059137268047012,4.785854275382693,0,0

多输入$ python -m mordred example.smi example2.smi -d ABCIndex

name