r语言t检验输出检验统计量_R语言执行两组间差异分析Wilcox秩和检验

最新推荐文章于 2024-06-20 15:30:48 发布

酷coo豆

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文章标签： r语言t检验输出检验统计量

本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_35122299/article/details/112539737

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当数据不满足正态性时，R语言中可以使用Wilcox秩和检验作为t检验的替代方法。通过示例，文章详细介绍了如何执行独立样本和配对样本的Wilcox检验，并展示了如何通过可视化和批处理来分析数据差异。

摘要由CSDN通过智能技术生成

两组间差异的非参数检验之Wilcox秩和检验在R中实现

在进行两组数据间的差异分析时，我们通常会想到使用t检验。但若数据不满足执行t检验的参数假设(例如数据分布不符合正态性，变量在本质上就严重偏倚或呈现有序关系)，无法使用t检验分析时，可以考虑使用非参数的方法来完成。

就两组数据的比较而言，wilcox秩和检验(或称Mann-Whitney U检验)是常见的非参数检验方法之一。本文简介怎样在R中进行wilcox秩和检验，以实现两组间非参数差异分析。本文使用的作图数据的网盘链接(提取码o8lr)： https://pan.baidu.com/s/1b-1INL4HFrsIOvs_0UfByw 文件“alpha.txt”为某16S细菌群落测序所获得的部分alpha多样性指数数据，包含3列信息： sample，样本名称； observed_species和shannon分别为两种类型的alpha多样性指数。文件“group.txt”为各样本分组信息，第一列(sample)为各样本名称；第二列(group)为各样本的分组信息。以上使用的示例数据与前文“R语言执行两组间差异分析T检验”中的数据一致。已知group3的shannon指数数据分布并不符合正态性，此时，若我们想比较group2和group3的shannon指数间是否存在显著差异，就不适合使用t检验(暂且不考虑对数据进行合理的转化后是否会满足t检验的参数假设)，可采用非参数的方法(本文中介绍使用wilcox秩和检验)去实现。

数据预处理及正态性假设检验

首先将上述两个数据表读入R中，并合并在一起，以及数据的正态分布检验。