Ubuntu下安装Circos

PS: 女票需要用circos画图, 但她不会用, 所以又到我出马了. 用惯了Ubuntu, 先把circos安装起来吧.

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下载

open source and free, 赞
官网: http://www.circos.ca/software/
下载: http://www.circos.ca/software/download/circos/

安装

1. Perl
   需要5.8及以上的版本.
   查看版本的命令:

perl -v

已经有了, 略过.
2. 解压安装包
安装包是一个tgz(.tar.gz的缩写)压缩包, 用tar vxzf解压.
进行解压后的文件夹, 执行:

./bin/circos

会发现报一大堆错误, 原因是缺少很多模块, 需要通过cpanm安装
3. 安装cpanm和依赖模块

sudo apt-get install cpanminus
sudo cpanm Clone Config::General Font::TTF::Font GD GD::Polyline Math::Bezier Math::Round Math::VecStat Params::Validate Readonly Regexp::Common SVG Set::IntSpan Statistics::Basic Text::Format