在linux中用高斯09优化分子结构,高斯09的优化 - 量子化学 - Gaussian - 小木虫论坛-学术科研互动平台...

新手在Linux环境下利用Gaussian 09进行小分子优化时遇到Error termination via Lnk1e错误。输入文件设置为opt=tight b3lyp/6-31g(d,p)等参数,求助解决该错误及如何从log文件获取优化后分子的pdb文件。" 122278292,11713989,C++编程:炫酷星星Show,"['C++', '游戏开发']
摘要由CSDN通过智能技术生成

求助高斯09,我是新人一枚,现在想做简单的小分子优化再和蛋白进行dock,我在linux系统下优化,这是input文件,计算后一直出现Error termination via Lnk1e in /home/zhang/g09/l1.exe 错误,求助大神如何解决。优化后获得log文件,我该如何通过log文件获得优化后的小分子的pdb文件呢。谢谢大家

%chk=deltarasin.chk

# opt=tight b3lyp/6-31g(d,p) nosymm scf=qc pop=mk iop(6/33=2.6/42=6.6/50=1)

deltarasin

0 1

H(PDBName=H,ResName=,ResNum=1)                        1.37600000   -3.11200000   -5.04800000

H(PDBName=H,ResName=,ResNum=1)                        3.77400000   -3.52800000   -5.40000000

H(PDBName=H,ResName=,ResNum=1)                        5.41000000   -2.72300000   -3.78500000

H(PDBName=H,ResName=,ResNum=1)                        2.55700000    1.30300000    1.75000000

H(PDBName=H,ResName=,ResNum=1)                        2.63100000    4.88200000   -0.49500000

H(PDBName=H,ResName=,ResNum=1)                        2.60900000    1.16300000   -2.48600000

H(PDBName=H,ResName=,ResNum=1)                       -7.19200000   -1.79500000    5.77500000

H(PDBName=H,ResName=,ResNum=1)                       -5.44500000   -0.33200000    5.09600000

H(PDBName=H,ResName=,ResNum=1)                       -7.89100000    0.35600000    5.03900000

H(PDBName=H,ResName=,ResNum=1)                       -9.09900000   -0.90500000    4.63700000

H(PDBName=H,ResName=,ResNum=1)                       -8.68900000    0.66700000    2.71000000

H(PDBName=H,ResName=,ResNum=1)                       -5.45400000    0.53000000   -0.88700000

H(PDBName=H,ResName=,ResNum=1)                      -10.13500000   -0.80700000   -2.01200000

H(PDBName=H,ResName=,ResNum=1)                   

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