python调用r语言函数_让R与Python共舞

R(又称R语言)是一款开源的跨平台的数值统计和数值图形化展现工具。通俗点说,R是用来做统计和画图的。R拥有自己的脚本语言和大量的统计、图形库(得益于开源社区),这让她看起来既美又实用。与其他同类软件(如 SPSS)相比,R的特点是纯命令行的,这倒也好,我们更应该把注意力放在数据本身,而非统计工具的UI。

R虽说有一套自己的语言,还挺完备,但她最专业的还是做统计和画图,而像连接数据库、文本处理、文件操作等这些脏活可不能委屈R来干哪,这些得有其他语言来负责,我的选择是咱最熟悉的、做这些脏活最棒的Python。那接下来的问题很清楚了,R和Python如何一起工作?拍拍脑袋,想到可能有下面几种办法:

1. R和Python只共享文件,Python把源数据处理干净,生成格式化的文件放在预定的目录下,做个定时器让R去读文件,最终输出统计结果和图表。

这种做法一定程度上可行,除了做定时器外,还可以让Python即时执行”rscript”命令调用R脚本来工作,只是这种办法限制太大,只能够交换文件,Python不能对R进行较精确的控制。

2. 让Python直接调用R的函数,R是开源项目,肯定会有一些第三方库实现Python与R互通。

果然,我找到了rpy2,可以实现使用python读取R的对象、调用R的方法以及Python与R数据结构转换等。实际上除了Python,其他语言与R互通的第三方包也大大的有。

最后我选择第2种方法,来让R与Python共舞。

模块 rpy2.robjects 是rpy2对R的一个高级封装,该模块里包含了一个r对象和一系列的R数据结构。使

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