生物信息mysql_生物信息学常用的数据库

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目前为止生物信息有关的数据库非常多,不仅仅包括上面介绍‍的‍UniPro,UCSC,TCGA,KEGG,String等,还包括非常多的其他数据库,像我们比较常用的做pythway分析和GO分析等都有自己的数据库,当然任何我们感兴趣的物种几乎也都有各自的数据库,如果没有的话,恭喜你,可以自己做一个此物种的数据库并且发一篇数据库文章了。

生物信息学的学习中除了一些常用的数据库外,还有一些常用的软件,像做序列分析的Blast;做聚类分析的Cluster/treeview,如果会编程R的话,可以用R里的函数heatmap一行命令就可以做出聚类图;做功能分析的David或者GSEA,以及做网络绘制的cytoscape,当然还有很多了。

这次把这些数据库和软件都简单的给大家列出来,以后大家遇到相关的问题知道用什么软件来做就OK了,接下来如果有时间,可以把每个数据库和软件详细的给大家讲解一下。

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