怎么用python实现序列比对_第6章 多序列比对

6.1.1 单一的序列比对¶

例如，请见以下PFAM(或者Stockholm)格式的蛋白序列比对文件。

# STOCKHOLM 1.0

#=GS COATB_BPIKE/30-81 AC P03620.1

#=GS COATB_BPIKE/30-81 DR PDB; 1ifl ; 1-52;

#=GS Q9T0Q8_BPIKE/1-52 AC Q9T0Q8.1

#=GS COATB_BPI22/32-83 AC P15416.1

#=GS COATB_BPM13/24-72 AC P69541.1

#=GS COATB_BPM13/24-72 DR PDB; 2cpb ; 1-49;

#=GS COATB_BPM13/24-72 DR PDB; 2cps ; 1-49;

#=GS COATB_BPZJ2/1-49 AC P03618.1

#=GS Q9T0Q9_BPFD/1-49 AC Q9T0Q9.1

#=GS Q9T0Q9_BPFD/1-49 DR PDB; 1nh4 A; 1-49;

#=GS COATB_BPIF1/22-73 AC P03619.2

#=GS COATB_BPIF1/22-73 DR PDB; 1ifk ; 1-50;

COATB_BPIKE/30-81 AEPNAATNYATEAMDSLKTQAIDLISQTWPVVTTVVVAGLVIRLFKKFSSKA

#=GR COATB_BPIKE/30-81 SS -HHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----

Q9T0Q8_BPIKE/1-52 AEPNAATNYATEAMDSLKTQAIDLISQTWPVVTTVVVAGLVIKLFKKFVSRA</