MIMIC数据提取教程 - 如何提取患者入ICU后第一个WBC和SpO2值

阅读本文建议先看这篇，里面有相关sql基础的解释

MIMIC数据提取教程 - 提取患者首次入ICU数据

一般情况下，我们也不会关心患者的所有临床指标，我们就再具体一些，比如： 如何提取患者入ICU后第一个WBC和SpO2值

WBC: white blood cell 白细胞,  对应itemid 51300, 51301

SpO2：血氧饱和度/脉氧饱和度  对应itemid  646 和 220277

涉及三个表格：

1，icustay记录了所有住ICU患者的id和住ICU时间和出ICU时间。

2，labevents记录了所有患者（包括没有住ICU的患者）的实验室检查。

3，chartevents记录了所有ICU患者的生命体征。

目标是所有住ICU患者，所以以icustay表里面记录的数据为准，三张表格共有的值为subject_id(每个患者的唯一号)，以此把三个表链接起来

如图，对应着同一个住ICU记录stay_id(30000153), 这个病人有很多次WBC白细胞检查记录，这里我们已经按照时间做了排序

那么我们加上一列序号。那么下面就是只选第一个就行了

即：把现在的结果通过with保存为临时表再筛选。

对SpO2可以同样操作，只是把labevents表换成chartevents就行了，最后把两个表连接起来就可以了

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在navicat里面，你检索出结果后会有一个导出结果按钮

ps: 有的同学表示下载的navicat不好用， 后台回复"navicat"获取破解版，附安装教程

支持导出不同格式

另外很多人导出为excel时会遇到这样一个错误， 其实是因为excel，只支持65535行。新冠刚出来的时候不是有个新闻说英国疾控部门用excel来统计新冠病人数据，因为超过65535行的限制导致病人漏统计了嘛？所以导出csv或者其他格式就不会存在这个问题。