ubuntu 16.04 安装anaconda tensorflow opencv keras openslide-python pycharm

安装anaconda

首先在anaconda的清华镜像 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/archive/

下载anaconda3-5.1.0-Linux-x86-64.sh

$ sudo bash Anaconda3-5.1.0-Linux-x86_64.sh

然后Do you accept the license terms? [yes|no]
输入yes

我直接安装在默认目录：Anaconda3 will now be installed into this location:
/home/cassiel/anaconda3

Do you wish the installer to prepend the Anaconda3 install location
to PATH in your /home/cassiel/.bashrc ? [yes|no]
[no] >>> yes
就会自动加入环境变量

$ sudo vim ~/.bashrc

可以看到末尾如图：

加入

$ export PATH="$PATH:$HOME/bin"

$ alias pyana3="/home/cassiel/anaconda3/bin/python3"    （写自己的用户名）

然后 输入 $ source ~/.bashrc 更新一下

安装tensorflow

首先创建虚拟环境：

conda create -n tf

激活虚拟环境：（就是进入到这个虚拟环境里面）

source activate tf

PS:如果要退出：输入 source deactivate tf    移除某环境 conda remove --n 环境名 --all

更改anconda下载镜像为清华仓库镜像（这样舒速度快一点）
打开Anaconda Prompt，输入清华仓库镜像，这样更新会快一些：

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --set show_channel_urls yes
 

激活虚拟环境（进入虚拟环境）后

输入 conda install tensorflow

然后等着吧。

再次进入python3.6,可以导入tensorflow了，（第一次打错tensorflow，吓死了）

退出镜像（source deactivate tf）在终端中输入 anaconda-navigator 可以打开图像管理界面

可以看到tf镜像和root

启动Tensorflow开发环境

有两种方法，

方法一，通过anaconda启动：

anaconda-navigator
#启动anaconda->home->(Applications on)tensorflow，启动相关开发软件

方法二，通过terminal启动：

source activate tensorflow # 激活Tensorflow环境
python # 或ipython或Spyder启动开发环境

安装opencv

参考： https://blog.csdn.net/isuccess88/article/details/73546835

在这个里面下载 https://anaconda.org/menpo/opencv3/files 我下载的是 opencv3-3.1.0-py36_0.tar.bz2

进入tf虚拟环境 source activate tf

conda install opencv3-3.1.0-py36_0.tar.bz2

可以导入opencv2

安装keras

在虚拟环境输入 pip install keras

如果遇到 pip install 提示权限不够 ，可以添加环境变量  export PATH=~/.local/bin:$PATH

参考至： https://blog.csdn.net/tanzuozhev/article/details/77585342

我习惯用jupyter，同样在虚拟环境输入conda install jupyter即可

再打开jupyter notebook 就可以了！ 

安装openslide-python

sudo apt-get install openslide-tools

sudo apt-get install python-openslide

进入虚拟环境

pip install openslide-python

可以import openslide

安装pycharm

https://www.jetbrains.com/pycharm/download/previous.html

找到linux版本，我用社区版足以

解压在 /文档 下，然后移动到 /usr/local下

sudo mv pycharm-community-2018.3.2/ /usr/local

 cd /usr/local/pycharm-community-2018.3.2/bin

 ./pycharm.sh

安装路径 /usr/local/bin/charm

安装成功后，打开file-setting，选择project interpreter，小齿轮，选择add 

参考：

https://blog.csdn.net/arpospf/article/details/80228587

https://blog.csdn.net/m0_37864814/article/details/82112029

https://blog.csdn.net/qq_28888837/article/details/80757731

https://blog.csdn.net/hgdwdtt/article/details/78633232

pycharm 参考文档： https://blog.csdn.net/johinieli/article/details/79575169

                                  https://blog.csdn.net/liangyihuai/article/details/77842628 

                                  https://blog.csdn.net/reallocing1/article/details/53375042

                                  https://blog.csdn.net/zhuanshu666/article/details/73554885